如何在 Cytoscape 中的每个节点上自动显示图像

Question

我有一个带有节点属性“source_img”的 Cytoscape (3.7.1) 网络。这包含通向我想在节点上表示的相应图像的路径。

我发现这篇文章：a custom image on each node in cytoscape 用于对图像使用离散映射，但用户需要选择和编辑每个节点/图像对，这对我来说并不理想，因为：

1. 我有超过 1000 个节点-图像对，因为它不够繁琐，Cytoscape Image Manager 需要很长时间才能启动。
2. 稍后我可能需要对其他图像执行此操作。

到目前为止，我尝试了以下方法：

1. 为离散映射设置默认值
2. 导出 cytoscape styles.xml 文件
3. 直接在xml文件中编辑离散映射的图片路径

我不成功，因为我不知道图像管理器中图像的 id，这显然在 xml 中也是必需的。

styles.xml 文件中的条目示例（node='1674', image='1674.png' and id=3 in bold）：

discreteMappingEntry attributeValue="/home/josemanuel/Tests/images/1674.png" value="org.cytoscape.ding.customgraphics.bitmap.URLImageCustomGraphics,3,/home/josemanuel/Tests /images/1674.png,位图图像"/>

我也尝试（但失败了）改为应用直通映射，所以我猜只有文件路径不足以使其工作？

我没有使用 py2cytoscape 的经验，但我也找不到任何为图像应用离散映射的示例。

如何在节点上自动显示相应的图像？

这是我想要达到的目标的说明：

Answer 1

我在这个帖子之后找到了如何做到这一点：

https://groups.google.com/forum/?hl=en_US/#!searchin/cytoscape-helpdesk/image|sort:date/cytoscape-helpdesk/nmSPX5AcY4U/V7-2BE5VAgAJ

关键是使用节点属性不是链接到相应图像文件的路径，而是它的 URL (file:///home/josemanuel/...)。

它仍然没有立即工作。图像本身的位置似乎存在限制。我在链接到图像文件的 URL 中没有任何特殊字符（只有字母数字和下划线），但是当我直接将整个图像文件夹复制/粘贴到我的主文件夹中的较短位置时，图像会按我想要的方式显示。

希望对大家有用！

干杯， 何塞·曼努埃尔