从字典中以 csv 格式写入输出

Question

能否请我就如何将我的输出写入制表符分隔格式获得建议？我正在将 csv 文件与字典进行比较。这是我的代码（这是我有问题的代码的结尾）：

import csv

file3 = open(r'file.csv','rt', newline = '')
baits = csv.reader(file3, delimiter = '\t')

file4 = open(r'file.txt','wt', newline = '')
common = csv.writer(file4, delimiter = '\t')

for line in baits:
    chromosome = line[0]
    start = int(line[1])
    end = int(line[2])
    if chromosome in dmc:
        for value in dmc[chromosome]:
            base = value[0]
            others = value[1:]
            if base >= start and base <= end:
                count_in += 1
                common.writerow(line + [base, others])

file3.close()
file4.close()

这是我的输出示例：

chr1    3505353 3505472 3505390 (['3505390', '-', '3.32682966730502e-08', '1.69470366570212e-07', '-35.4239256678281', '1', '156190', 'NM_001011874', '-'],)                                        
chr1    3601312 3601671 3601347 (['3601347', '-', '1.94815734655407e-08', '1.01925267518696e-07', '-40.8010680907877', '2', '60233', 'NM_001011874', '-'],)                                     

我在尝试摆脱大括号和 '' 时遇到问题，以便大括号中的每个值都是制表符分隔的。

有人知道可以修改代码来实现吗？

谢谢！

Answer 1

如果不在这里看到您的数据很难判断，但我猜它看起来像这样：

line = ['chr', 3505353, 3505472]
base = 3505390
others = (['3505390', '-', '3.32682966730502e-08', '1.69470366570212e-07', '-35.4239256678281', '1', '156190', 'NM_001011874', '-'],)

如果是这样，line + [base, others] 将是：

['chr', 3505353, 3505472, 3505390,  (['3505390', '-', '3.32682966730502e-08', '1.69470366570212e-07', '-35.4239256678281', '1', '156190', 'NM_001011874', '-'],)]

换句话说，五列，其中最后一个是一个元组，其中包含一个包含一堆值的列表。

我不确切知道您想要什么输出，但我假设该元组中的每个列表都意味着一个新行，而该列表只是一堆额外的列。在这种情况下：

if base >= start and base <= end:
    count_in += 1
    for other in others:
        common.writerow(line + [base] + others)

这会给你一个看起来像这样的行：

chr1    3505353 3505472 3505390 3505390 - 3.32682966730502e-08 1.69470366570212e-07 -35.4239256678281 1 156190 NM_001011874 -

无论如何，获得所需输出的唯一方法是获取列值列表。而且调试正确的列表要容易得多。尝试打印出这些碎片，然后计算出将这些碎片放在一个平面列表中需要做的事情。一旦你有了它，你就完成了。

Answer 2

我猜——因为你的问题缺少很多信息——你需要改变这一行：

            common.writerow(line + [base, others])

到这里：

            common.writerow(line + list(value))

另外，csvfiles 应该以'rb'或'wb'的模式打开。