rcpp jupyter 笔记本

Question

我已经使用这个命令在 R 控制台中安装了 Rcpp，直到现在通常用于安装包以在 jupyter 笔记本上运行：

install.packages('Rcpp', '/home/user/anaconda3/lib/R/library/')

然后在控制台中我这样做：

library(Rcpp)
evalCpp("2+2")

它可以工作，但是当我在 Jupyter 笔记本上做同样的事情时它不起作用，给我这个错误消息：

/home/tyatabe/anaconda3/bin/x86_64-conda_cos6-linux-gnu-c++ -I/home/tyatabe/anaconda3/lib/R/include -DNDEBUG -I'/home/tyatabe/anaconda3/lib/R/library/SimInf/include' -I"/home/tyatabe/anaconda3/lib/R/库/Rcpp/include"-I"/tmp/RtmpC4usUT/sourceCpp-x86_64-conda_cos6-linux-gnu-0.12.15"-D_FORTIFY_SOURCE=2 -O2 -I/home/tyatabe/anaconda3/include -fpic -O3 -mtune =native -march=native -Wno-unused-variable -Wno-unused-function -flto -ffat-lto-objects -Wno-unused-local-typedefs -Wno-ignored-attributes -Wno-deprecated-declarations -c file345f2e80a7c7。 cpp -o 文件345f2e80a7c7.o /home/tyatabe/anaconda3/lib/R/etc/Makeconf:167：目标配方 'file345f2e80a7c7.o' 失败 sourceCpp 中的错误（代码 = 代码，环境 = 环境， 重建 = 重建，cacheDir = cacheDir，：错误 1 ​​发生构建 共享库。追溯：

1. evalCpp("2+2")
2. cppFunction（代码，依赖 = 依赖，插件 = 插件，包括 = 包含，.env = env，重建 = 重建，cacheDir = cacheDir， 显示输出 = 显示输出，。详细 = 详细）
3. sourceCpp（代码 = 代码，环境 = 环境，重建 = 重建，缓存目录 = 缓存目录，.showOutput = 显示输出，详细 = 详细）
4. stop("错误 ", status, "发生构建共享库。")

警告：未找到为 R 构建 C++ 代码所需的工具。

请安装 GNU 开发工具，包括 C++ 编译器。

我在 64 位机器上运行 Ubuntu 16.04。

关于如何让 Rcpp 在 jupyter 上工作的任何想法？

谢谢，

多田

Answer 1

正如@DirkEddelbuettel 提到的...... Anaconda 在 Ubuntu 上并不理想......

如果您真的想要进行此设置，最近有一个关于编译器和 Anaconda 的 Rcpp FAQ 条目...特别是，我们有：

在issue ticket#770的评论中 据说运行

sh conda install gxx_linux-64

在此环境中提供帮助，因为它安装了相应的 x86_64-conda_cos6-linux-gnu-c++ 编译器。

Answer 2

我通常建议不要混合使用 Ubuntu（一切按原样运行）和 Anaconda（有时会妨碍）。

我的盒子上也使用了 Jupyter 笔记本。