R包构建，“找不到对象'xxx'的原因”

Question

我正在尝试从在包外工作的代码构建一个 R 包。我的第一次尝试是相当复杂的嵌套函数，最终使用 doMPI 和 foreach 进行并行处理。还在 Ubuntu 16.04 上使用 RStudio 1.01.43。我构建了软件包并且工作正常。然后，当我尝试运行调用 next 的顶级函数时，它会引发错误：

Error in { : task 6 failed - "object 'RunOys' not found" 

我在调用顶级函数之前手动设置布尔变量 RunOys=TRUE，当它下降到为 ifelse 语句调用此变量的那个时，它会失败。在调用顶级函数之前，我检查 globalenv() 和

> RunOys
[1] TRUE

在 foreach 并行代码中，我有这个语句，它在编译成 R 包之前一直有效：

FinalCalcs <- function (...) {
    results <- data.frame ( foreach::`%dopar%`(
             foreach::`%:%`(foreach::foreach(j = 1:NumSim, .combine = acomb,
                                             .options.mpi=opts1),
                            foreach::foreach (i = 1:PopSize, .combine=rbind,
                                    .options.mpi=opts2,
                                    .export = c(ls(globalenv())),
                                    .packages = c("zoo", "msm", "FAdist", "qmra"))),
                            {

它应该将 globalenv() 中的所有对象导出到每个从站。

我不明白为什么有些变量似乎被传递了，而其他变量却没有。我是否需要在文件中为调用它的函数明确指定它为@param？

Answer 1

使用foreach，更好的是让所有需要的变量都存在于调用foreach 的同一环境中。所以基本上，我总是在函数内部使用foreach，并将foreach 中需要的所有变量传递给这个函数。

就好像foreach 看不到它的调用函数一样。你不需要导出任何东西。对于函数，请使用package::function（就像在包中一样，这样您就不需要@import 包）。