R：在 Gephi 中使用的结构标签数据

【问题标题】：R: Structure tag data for use in GephiR：在 Gephi 中使用的结构标签数据
【发布时间】：2015-02-13 22:21:45
【问题描述】：

我准备了一个数据集，其中包含大约 20k 行唯一标识符和约 60 列包含布尔信息（如果标签连接到该标识符）：

ID   Gender   Tag1   Tag2   Tag3   Tag4   Tag5   Tag6   Tag 7   ...
A    m        0      1      1      0      0      0      0       ...
B    m        1      0      1      0      0      1      0       ...
C    f        1      1      0      0      0      1      1       ...

我想探索 Gephi 中的数据，但不知道要使用什么导出结构/格式。为了能够探索标签之间的关系，数据应该是什么样子？我需要做什么才能到达这个结构？是否需要进一步总结，是否可以将性别数据保留在其中作为属性进行分析？

【问题讨论】：

标签： r gephi network-analysis

【解决方案1】：

假设您的数据代表一个网络，这里有一种将其导出为边缘列表 csv 的方法：

df <- read.table(header =T, sep =";", text = "ID;Gender;Tag1;Tag2;Tag3;Tag4;Tag5;Tag6;Tag7
A;m;0;1;1;0;0;0;0
B;m;1;0;1;0;0;1;0
C;f;1;1;0;0;0;1;1")

library(dplyr)
library(tidyr)
library(magrittr)
df %>%
  gather(Target, isTrue, -ID, -Gender) %>%
  filter(isTrue == 1) %>%
  select(-isTrue) %>%
  set_names(c("Source", "Gender", "Target")) %>%
  write.csv(file = file.path(tempdir(), "my.csv"), row.names = FALSE)

可以在Gephi中作为边列表导入，让gephi自动创建节点列表：

【讨论】：

谢谢 - 我很好奇，magrittr 包有什么作用？它是否为 dplyr 的管道添加了功能？
是的，如果你想这样说的话，它就是 dplyr 管道的来源。在示例中，它提供了 set_names 函数。