pyopencl 导入错误 cffi.so 未定义符号

Question

我成功安装了 pyopencl，但出现导入错误。我被困在这里，无法进一步进步。任何帮助将不胜感激

---

ImportError Traceback（最近一次调用最后一次） 在 ()

  5 from __future__ import division

  6 import numpy as np

----> 7 导入pyopencl

  8 import pyopencl.array

  9 import math, time 

/home/highschool/anaconda2/lib/python2.7/site-packages/pyopencl-2016.2-py2.7-linux-x86_64.egg/pyopencl/init.py in () 32

 33 try: 

---> 34 import pyopencl.cffi_cl as _cl

 35 except ImportError:

 36     import os

/home/highschool/anaconda2/lib/python2.7/site-packages/pyopencl-2016.2-py2.7-linux-x86_64.egg/pyopencl/cffi_cl.py in ()

 37 from pytools import memoize_method

 38 

---> 39 from pyopencl._cffi import ffi as _ffi

 40 from .compyte.array import f_contiguous_strides, c_contiguous_strides

 41 

ImportError：/home/highschool/anaconda2/lib/python2.7/site-packages/pyopencl-2016.2-py2.7-linux-x86_64.egg/pyopencl/_cffi.so：未定义符号：_ZTVNSt7__cxx1115basic_stringbufIcSt11char_traitsIcESaIcEEE

Answer 1

问题是libstdc++ 中的dual ABI 带有gcc5.1 用于std::string 和std::list。 Anaconda 现在安装 libstdc++.so.6.0.19（可能是因为他们添加了一个带有 C++ 库的 Python 包）from gcc 4.8.3 and pre dual ABI，而 Ubuntu 16.04 带有 gcc 5.4 和 libstdc++.6.0.21。当您构建 pyopencl 时，它会构建并链接到您的系统 libstdc++ 但是当您尝试导入 pyopencl 时，它会动态链接到 Anaconda 并且无法找到符号。

应该可以通过将-D_GLIBCXX_USE_CXX11_ABI=0 添加到pyopencl siteconf.py 中的CXXFLAGS 列表来解决这个问题。这解决了std::string 问题，但还缺少其他符号：

ImportError: /home/cryan/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/pyopencl-2016.2.1-py3.6-linux-x86_64.egg/pyopencl/_cffi.abi3.so: undefined symbol: _ZNSt6thread15_M_start_threadESt10shared_ptrINS_10_Impl_baseEEPFvvE

您的选择是：

1. 从 Anaconda (conda install gcc) 安装 gcc 并使用它构建 pyopencl。不幸的是，如果您的 PATH 上有 Anaconda，您将在任何地方使用他们的 gcc。
2. 只需删除/重命名~/anaconda3/lib 中的libstdc++：cd ~/anaconda3/lib; mv libstdc++.so libstdc++.annoying; mv libstdc++.so.6 libstdc++.annoying.6。 Python 模块会找到你的系统，它应该是向后兼容的。

Answer 2

我遇到了完全相同的同样的问题。

ImportErrorTraceback (most recent call last)
<ipython-input-1-f1779268ba42> in <module>()
----> 1 import pyopencl as cl

/opt/anaconda2/lib/python2.7/site-packages/pyopencl/__init__.py in <module>()
     32 
     33 try:
---> 34     import pyopencl.cffi_cl as _cl
     35 except ImportError:
     36     import os

/opt/anaconda2/lib/python2.7/site-packages/pyopencl/cffi_cl.py in <module>()
     37 from pytools import memoize_method
     38 
---> 39 from pyopencl._cffi import ffi as _ffi
     40 from .compyte.array import f_contiguous_strides, c_contiguous_strides
     41 

ImportError: /opt/anaconda2/lib/python2.7/site-packages/pyopencl/_cffi.so: undefined symbol: _ZTVNSt7__cxx1115basic_stringbufIcSt11char_traitsIcESaIcEEE

我在 Ubuntu 16.04 上，使用 AMDAPPSDK-3.0 中的 libOpenCL.so。我能够运行这个 SDK 中包含的一些 OpenCL 示例，所以我相信这是一个 pyopencl 问题。