ImageJ：.show() 不显示图像

Question

我对 javascript 非常陌生，我想在斐济处理一些图像。我使用宏语言已经有一段时间了，但我正在尝试熟悉正式的 ImageJ/Fiji API。我正在尝试运行以下简单的代码，它运行没有错误，但最终没有显示任何图像。怎么了？

importClass(Packages.ij.plugin.filter.GaussianBlur);


var image = IJ.openImage("/home/.../KNIIC_BC_Cam2_AirBubble2_Image1038.bmp");
IJ.run(image, "8-bit", "");

var dpl = image.getProcessor().duplicate();
var gs = new GaussianBlur();
gs.blur(dpl,20);
new ImagePlus(gs).show();

提前致谢

Answer 1

问题在于您如何处理ImagePlus：在最后一行中，您尝试创建一个new ImagePlus，但其中不可能包含您加载的图像的任何信息。

GaussianBlur 处理您将通过ImagePlus#getProcessor() 方法获得的ImageProcessor。如果您查看API documentation，您还会看到blur(ImageProcessor,double) 已被弃用，取而代之的是其他方法之一：您可能想在此处使用blurGaussian(ImageProcessor, double, double, double)。

这段代码可以工作：

importClass(Packages.ij.plugin.filter.GaussianBlur);

var imp = IJ.openImage("http://imagej.nih.gov/ij/images/clown.jpg");
IJ.run(imp, "8-bit", "");

var ip = imp.getProcessor();
var gs = new GaussianBlur();
gs.blurGaussian(ip,20,20,0.01);
imp.show();

但是它使用低级方式干扰GaussianBlur 类。为了让您的生活更轻松，您还可以通过 Plugins > Macros > Record... 在 GUI 中记录 javascript 命令，然后在执行高斯模糊之前选择 Record: Javascript通过 Process > Filters > Gaussian Blur...。这将使您的代码更短：

var imp = IJ.openImage("http://imagej.nih.gov/ij/images/clown.jpg");
IJ.run(imp, "8-bit", "");
IJ.run(imp, "Gaussian Blur...", "sigma=20");

imp.show();

有关 ImageJ 中 Javascript 脚本的一般帮助，请参阅 these two 指向斐济 wiki 的链接。

编辑：从ImageJ 1.47n5开始，ImageProcessor有一个新方法blurGaussian(double sigma)，将上面的（低级）代码缩短为：

var imp = IJ.openImage("http://imagej.nih.gov/ij/images/clown.jpg");
IJ.run(imp, "8-bit", "");
imp.getProcessor().blurGaussian(20);
imp.show();