在 ImageJ 中批量测量曲线的面积和长度答案

【问题标题】：Batch measuring area and lengths of curves in ImageJ在 ImageJ 中批量测量曲线的面积和长度
【发布时间】：2020-05-28 20:23:04
【问题描述】：

Here is my reference image，StackOverflow 不允许我将其嵌入到这篇文章中。

我想知道是否可以使用 ImageJ 或其他免费软件来测量所有红色曲线的长度（以毫米为单位）和蓝色形状的面积（以平方毫米为单位），标准化为长度绿色比例尺（1 毫米）。

如果可以自动获取批量图像的这些测量值，那将是理想的选择。如果这样可以使这项任务更容易，我可以使用不同的颜色。

非常感谢您提供的任何反馈。

【问题讨论】：

在 ImageJ 中绝对可以做到这一点。您可以根据颜色对图像进行分割并获得所需的测量值。对于红色曲线，您应该查看分割图像的“骨架化”。一旦有了适用于一个图像的方法，就可以直接对目录中的所有图像执行相同的操作。请注意，您的问题对于 SO 有点开放，可能会被删除。这里的问题需要更有针对性，例如我的代码给了我这个错误 - 我该如何解决？ forum.image.sc 更适合一般指导。希望这会有所帮助！
这很有帮助，非常感谢！

标签： image image-processing batch-processing imagej

【解决方案1】：

当然可以，但需要了解 ImageJ 中的许多不同工具（例如，分割、ROI 管理器、粒子分析、测量、形状过滤器插件、ImageJ 宏）。好消息是，网上有很多资源可以准确地完成这些类型的任务。了解细分是最好的起点Segmentation in ImageJ。在那之后我读到了Particle Analysis。一旦你用一张图像手动练习了一点，然后我会深入研究 ImageJ 宏语言来学习编写代码来自动化处理单个图像的过程，然后进入批处理Image J Macro Language。

这似乎是一项巨大的时间投资，但恕我直言，这是一项非常有趣且有益的工作。自动化数据分析（您分享的图像看起来像果蝇的翅膀，所以我猜您会做很多这样的测量）确实可以让您的生活更轻松，同时也可以带来更可靠/可重复的结果。

【讨论】：

非常感谢，这非常有帮助。