如何在多台计算机上使用 GNU 并行

Question

我想在我的两台计算机上使用 GNU 并行。我成功地在一台计算机上并行运行，但我无法在远程计算机上并行运行。

版本：本地：parallel-20140222，远程：parallel-20130522。我启用了无密码 ssh 登录。

parallel -j+0 --eta 'muscle -in {} -out {.}.aln -quiet' < list

但是当我尝试使用以下命令在远程计算机上“并行”运行时，

1) 时间并行 -j+0 --eta -Svaramesh@10.117.173.5,: -transfer, --return {.}.aln --cleanup 'muscle -in {} -out {.}.aln -安静'

2) 时间并行 -j+0 --eta -S10.117.173.5,: -transfer, --return {.}.aln --cleanup '肌肉 -in {} -out {.}.aln -安静'

3) 时间并行 -j+0 --eta -S :,10.117.10.5 -transfer, --return {.}.aln --cleanup 'muscle -in {} -out {.}.aln -quiet '

他们都给出以下错误

parallel: Error: Cannot open input file `nsfer,': No such file or directory.

Answer 1

转帐有双破折号，没有逗号：--transfer

您可能想要使用--transfer --return --cleanup 的简写：--trc {.}.aln

而且由于您没有特殊的 shell 字符，因此您不需要在 muscle -in {} -out {.}.aln -quiet 周围使用 '。

如果你喜欢--eta，你可能也想试试--bar。