尝试通过 Python 访问公共 FHIR (RESTFul) 端点时的 AuthenticationRequired 响应

Question

我正在学习需要访问公共 FHIR 端点的课程。我正在尝试通过 Python 执行此操作，但收到 407 AuthenticationRequired 响应，而这应该是公共服务器。

我已与课程管理员核实，并确信这应该是公共服务器。我可以通过浏览器轻松处理获取请求（请注意，这都是虚构的患者数据）：如果我访问 URI http://fhir.hl7fundamentals.org/r4/Patient/17120，我会在浏览器中得到预期的响应。

HTTP 200 OK 响应标头 X-Powered-By: HAPI FHIR 3.7.0-SNAPSHOT REST 服务器（FHIR 服务器；FHIR 4.0.0/R4）内容类型： 应用程序/fhir+xml;charset=utf-8

响应正文 { "resourceType": “患者”，“id”：“17120”，“元”：{ “版本号”：“22”， "lastUpdated": "2020-07-31T03:55:59.144+00:00" }.....

当我尝试通过 Python 对同一资源发出 get 请求时，我得到了 AuthenticationRequired。

import requests
r = requests.get('http://fhir.hl7fundamentals.org/r4/Patient/17120')
r.content

Out[24]: b'<!--Title-->\nAuthenticationRequired\n<!--/Title-->\n<!--Content-->\n407\n<!--/Content-->'

如果这是一个公共服务器，这意味着我可能在 Python 方面做错了 - 关于我可能做错了什么或为什么我得到 AuthenticationRequired 的任何想法？

Answer 1

使用 Python 3.6+ 和 Jupyter Notebooks（可选）

使用 Python 请求库的基本 FHIR Restful API

from requests import get,post
from json import loads, dumps
from IPython.display import display, HTML, Markdown

ref_server = 'http://fhir.hl7fundamentals.org/r4'
r_type ='Patient'
r_id = '17120'
headers = {
    'Accept':'application/fhir+json',
    'Content-Type':'application/fhir+json'
    }

获取资源

def fetch_me(r_type, r_id):
    print(f'fetching FHIR {r_type} with id = {r_id} from {ref_server}...')
    r = get(f'{ref_server}/{r_type}/{r_id}', headers = headers)
    display(HTML(
        '<h1>Validation output</h1>'
        f'<h3>Status Code = {r.status_code}</h3>'
        f'<strong>Narrative:</strong>\n {r.json()["text"]["div"]}\n'
        f'<strong>Raw JSON:</strong>\n<pre>{dumps(r.json(),indent=4)}</pre>'
        ))


fetch_me(r_type, r_id)        

fetching FHIR Patient with id = 17120 from http://fhir.hl7fundamentals.org/r4...

验证输出

状态码 = 200

叙述： FERCAM ID # 19282

原始 JSON：

{ "resourceType": "病人", “id”：“17120”， “元”：{ “版本号”：“22”， “上次更新”：“2020-07-31T03:55:59.144+00:00” }, “文本”： { “状态”：“生成”， "div": " \n FERCAM ID # 19282 \n " }, “标识符”：[ { “系统”：“https://www.hospitalitaliano.org.ar/Patient”， “价值”：“123456” } ], “姓名”： [ { "family": "Campos_new", “给定”：[ “费尔南多新” ] } ], “地址”： [ { “线”： [ “1111葡萄糖” ], “城市”：“安娜堡”， “州”：“密歇根西部”， “国家”：“美国” } ], “管理组织”：{ “参考”：“组织/2” } }