制作散点轮廓

Question

在python中，如果我有一组数据

x, y, z

我可以做一个分散的

import matplotlib.pyplot as plt
plt.scatter(x,y,c=z)

我怎样才能得到一个 plt.contourf(x,y,z) 的 scatter ？

Answer 1

您可以按照this other answer的b.的建议使用tricontourf：

import matplotlib.tri as tri
import matplotlib.pyplot as plt

plt.tricontour(x, y, z, 15, linewidths=0.5, colors='k')
plt.tricontourf(x, y, z, 15)

旧回复：

使用以下函数转换为contourf所需的格式：

from numpy import linspace, meshgrid
from matplotlib.mlab import griddata

def grid(x, y, z, resX=100, resY=100):
    "Convert 3 column data to matplotlib grid"
    xi = linspace(min(x), max(x), resX)
    yi = linspace(min(y), max(y), resY)
    Z = griddata(x, y, z, xi, yi)
    X, Y = meshgrid(xi, yi)
    return X, Y, Z

现在你可以这样做了：

X, Y, Z = grid(x, y, z)
plt.contourf(X, Y, Z)

Answer 2

解决方案将取决于数据的组织方式。

常规网格上的数据

如果x 和y 数据已经定义了一个网格，则可以轻松地将它们重新调整为四边形网格。例如

#x  y  z
 4  1  3
 6  1  8
 8  1 -9
 4  2 10
 6  2 -1
 8  2 -8
 4  3  8
 6  3 -9
 8  3  0
 4  4 -1
 6  4 -8
 8  4  8 

可以使用

绘制为contour

import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
x,y,z = np.loadtxt("data.txt", unpack=True)
plt.contour(x.reshape(4,3), y.reshape(4,3), z.reshape(4,3))

任意数据

一个。插值

如果数据不在四边形网格上，可以在网格上插入数据。一种方法是scipy.interpolate.griddata

import numpy as np
from scipy.interpolate import griddata

xi = np.linspace(4, 8, 10)
yi = np.linspace(1, 4, 10)
zi = griddata((x, y), z, (xi[None,:], yi[:,None]), method='linear')
plt.contour(xi, yi, zi)

b.非网格轮廓

最后，无需使用四边形网格即可完全绘制轮廓。这可以使用tricontour 来完成。

plt.tricontour(x,y,z)

在matplotlib page 上可以找到比较后两种方法的示例。

Answer 3

contour 需要定期网格化数据。因此，您需要先插入数据：

import numpy as np
from scipy.interpolate import griddata
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy.ma as ma
from numpy.random import uniform, seed
# make up some randomly distributed data
seed(1234)
npts = 200
x = uniform(-2,2,npts)
y = uniform(-2,2,npts)
z = x*np.exp(-x**2-y**2)
# define grid.
xi = np.linspace(-2.1,2.1,100)
yi = np.linspace(-2.1,2.1,100)
# grid the data.
zi = griddata((x, y), z, (xi[None,:], yi[:,None]), method='cubic')
# contour the gridded data, plotting dots at the randomly spaced data points.
CS = plt.contour(xi,yi,zi,15,linewidths=0.5,colors='k')
CS = plt.contourf(xi,yi,zi,15,cmap=plt.cm.jet)
plt.colorbar() # draw colorbar
# plot data points.
plt.scatter(x,y,marker='o',c='b',s=5)
plt.xlim(-2,2)
plt.ylim(-2,2)
plt.title('griddata test (%d points)' % npts)
plt.show()

请注意，我无耻地从优秀的 matplotlib cookbook 那里窃取了这段代码