无法使用 Numpy 和 Matplotlib 在 Python 中绘制 3D 医学图像

Question

我想使用 Python、Numpy 和 Matplotlib 绘制 3D 医学图像。我一直在尝试使用以下 sn-p 来显示它们，但图像本身不会呈现。

import os
import imageio
import matplotlib.pyplot as plt, numpy as np
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D

def make_ax(grid=False):
    fig = plt.figure()
    ax = fig.gca(projection='3d')
    ax.set_xlabel("x")
    ax.set_ylabel("y")
    ax.set_zlabel("z")
    ax.grid(grid)
    return ax

x=os.listdir('Path to .dcm images')
print(x)
vol = imageio.volread('Path to .dcm images') 
print(vol.shape)

ax = make_ax(True)
ax.voxels(vol, edgecolors='gray')
plt.show()

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Link for data

Answer 1

voxel 需要布尔值 - 或者根据docs 可以被视为布尔值的东西。您正在传递整数数据，任何非零都被视为真。您的大部分数据都是非零的，因此您得到了显示的大灰色立方体。它的呈现方式没有任何问题 - 您只是选择了错误的方式来可视化您拥有的数据。