MPI 内存泄漏答案

【问题标题】：MPI memory leakMPI 内存泄漏
【发布时间】：2018-08-28 02:24:27
【问题描述】：

我正在编写一些使用 MPI 的代码，并且在使用 valgrind 运行它时一直注意到一些内存泄漏。在试图确定问题出在哪里时，我最终得到了这个简单（而且完全没用）的主要内容：

#include "/usr/include/mpi/mpi.h"

int main(int argc,char** argv)
{
MPI_Init(&argc, &argv);
MPI_Finalize();
return 0;
}

如您所见，这段代码没有做任何事情，也不应该产生任何问题。但是，当我使用 valgrind 运行代码时（在串行和并行情况下），我得到以下摘要：

==28271== 堆摘要：

==28271== 在退出时使用：2,745 个块中的 190,826 个字节

==28271== 总堆使用量：11,214 次分配，8,469 次释放，16,487,977 字节分配

==28271==

==28271== 泄漏摘要：

==28271== 肯定丢失了：55 个块中的 5,950 个字节

==28271== 间接丢失：32 个块中的 3,562 个字节

==28271== 可能丢失：0 个块中的 0 个字节

==28271== 仍可访问：2,658 个块中的 181,314 个字节

==28271== 抑制：0 个块中的 0 个字节

我不明白为什么会有这些泄漏。也许只是我无法读取 valgrind 输出或正确使用 MPI 初始化/终结...

如果有帮助的话，我在 ubuntu 下使用 OMPI 1.4.1-3 和 64 位架构。

非常感谢您的宝贵时间！

【问题讨论】：

标签： memory-leaks mpi valgrind

【解决方案1】：

OpenMPI 常见问题解答地址为issues with valgrind。这指的是最终确定期间的初始化问题和内存泄漏 - 这应该没有实际的负面影响。

在很多情况下，Open MPI 故意不初始化并随后与内存通信，例如，通过调用写v。此外，已知几种情况，其中内存不在 MPI_Finalize 时正确释放。

这当然无助于区分真假积极的一面。 Valgrind 提供了抑制错误和来自某些函数上下文的警告。

为了简化使用 Valgrind 的调试，从 v1.5 开始， Open MPI 提供了一个所谓的 Valgrind-suppression 文件，可以在命令行传递：
mpirun -np 2 valgrind
--suppressions=$PREFIX/share/openmpi/openmpi-valgrind.supp

【讨论】：

请注意过滤器仅适用于未初始化的数据。 Open MPI 中存在真正的内存泄漏。幸运的是，它们大多发生在完成时，因此它们不依赖于应用程序正在做什么，因此它们大部分时间都不会被发现。

【解决方案2】：

你没有做错任何事。 valgrind 的 Memcheck 误报很常见，你能做的最好的就是抑制它们。

手册的This page 更多地谈到了这些误报。接近尾声的一句话：

包装器应降低 Memcheck 在 MPI 上的错误错误率应用程序。因为包装是在 MPI 接口完成的，所以有仍然可能会在 MPI 中报告大量错误接口下的实现。你能做的最好的就是尝试压制他们。

【讨论】：