SLURM 错误：sbatch：错误：批处理作业提交失败：请求的节点配置不可用

Question

我正在尝试使用集群来运行 MPI 代码。集群硬件由 30 个节点组成，每个节点具有以下规格： 2 个插槽 16 核（Intel Xeon e5-2650 v2）-（启用多线程的 32 核） 64 GByte 1866 MT/s 主内存 命名：咏叹调

slurm 配置文件如下：

#SBATCH --ntasks=64                     # Number of MPI ranks
#SBATCH --cpus-per-task=1               # Number of cores per MPI rank
#SBATCH --nodes=2                       # Number of nodes
#SBATCH --ntasks-per-node=32             # How many tasks on each node
#SBATCH --ntasks-per-socket=16          # How many tasks on each CPU or socket
#SBATCH --mem-per-cpu=100mb             # Memory per core

当我提交作业时，返回消息包含以下内容：sbatch：错误：批处理作业提交失败：请求的节点配置不可用 这有点令人困惑。我每个 cpu 提交一个任务，并在节点和套接字之间平均分配任务，有人可以就上述配置的问题提出建议吗？还有一件事：根据硬件规格，最佳配置是什么？

提前致谢

Answer 1

使用sinfo -Nl 命令准确查看节点提供的功能。

如果可以的话：

• 未启用超线程（HPC 集群上经常出现这种情况）
• 或为 Slurm 和操作系统保留一个内核
• 或超线程已启用，但 Slurm 配置为调度物理内核

至于最佳作业配置，取决于如何定义“最佳”。为了获得最佳的解决时间，通常最好让 Slurm 决定如何在节点上组织等级，因为这样它将能够更快地开始您的工作。

#SBATCH --ntasks=64                     # Number of MPI ranks
#SBATCH --mem-per-cpu=100mb             # Memory per core

为了获得最佳工作绩效（在基准测试或成本分析等情况下），您还需要将转换考虑在内。 （虽然有 30 个节点你可能只有一个交换机）

#SBATCH --ntasks=64                     # Number of MPI ranks
#SBATCH --exclusive
#SBATCH --switches=1
#SBATCH --mem-per-cpu=100mb             # Memory per core

使用--exclusive 将确保您的工作不会受到其他工作的干扰。