Eclipse PTP OpenMPI 并行运行/调试答案

【问题标题】：Eclipse PTP OpenMPI parallel run/debugEclipse PTP OpenMPI 并行运行/调试
【发布时间】：2013-10-22 17:27:42
【问题描述】：

有人可以说明如何使用本地机器上的实际并行运行/调试模式在 Eclipse PTP 中运行/调试 OpenMPI (C/C++/Fortran) 程序吗？

我在“远程环境”部分设置了本地连接。如果我将实际的程序可执行文件指定为可执行文件，那么 Eclipse 会在进度窗口中出现“提交交互”和“正在启动...提交作业...”，我只剩下指定数量的进程程序无限期地以全 CPU 运行。如果我指定另一个程序，如 mpirun 或 mpiexec，并提供必要的参数来获取程序可执行文件，那么唯一的区别是我在 0 CPU 上运行相同数量的 mpirun。

我应该补充一点，如果我实际上在“连接类型”下选择了“本地”，那么我会收到一个错误：

执行命令失败：ompi_info -a --parseable

原因：无法运行程序“ompi_info”：未知原因

即使该命令在命令行中运行良好，并且在“远程环境”中设置为连接到本地主机时成功运行

我在 Eclipse 网站上看到了指南，但它们没有帮助。我检查了[1] 和[2]，但我仍然可以正常工作。

我可以通过将程序视为普通程序并将可执行文件设置为 mpiexec 并提供必要的参数来成功地并行运行，但我想做实际的并行调试，所以这还不够。

编辑：我应该更具体。我知道还有其他调试方法，但是 Eclipse PTP（并行工具平台）应该能够完美地处理这个问题，所以我正在寻找在本地机器上设置 Eclipse PTP 以便他们可以使用的人的解释并行运行配置和并行调试工具。

【问题讨论】：

标签： c++ c eclipse parallel-processing fortran

【解决方案1】：

请在 ptp-user 邮件列表中提出您的问题。 https://dev.eclipse.org/mailman/listinfo/ptp-user 听起来 openmpi 不在 eclipse 中可用的路径中

事实上，这在 https://wiki.eclipse.org/Parallel_Tools_Platform_FAQ#Q:_I_get_the_error_.22Failed_to_execute_command:_ompi_info_-a_--parseable.22_when_I_use_the_Open_MPI_target_configuration_on_my_Mac 上的 PTP 常见问题解答中

【讨论】：

【解决方案2】：

我从未真正使用过 Eclipse IDE，但我使用 xterm 和 gdb 调试了我的 MPI 代码：

mpirun -np 2 xterm -e gdb -ex run ./tool

不完全是你想要的，但也许它会有所帮助......

【讨论】：

谢谢。我正在寻找使用这个特定工具的说明，但我最终可能会求助于像这样的另一种方法。

【解决方案3】：

不确定您使用的是哪个操作系统，但我在 MacOS 上遇到了这个问题。这是因为 Eclipse 不运行 .bash_profile 或 .bashrc，所以它的环境（即PATH）不会有它需要的一切。您可以尝试编辑PATH 变量以将其包含在some other means 中（我发现它在Mac 上过于复杂），或者您可以从shell 运行eclipse 可执行文件，以便它继承您的典型环境。对我来说，它位于：

~/eclipse/parallel-neon/Eclipse.app/Contents/MacOS/eclipse

然后eclipse能够很好地检测到OpenMPI（PATH包含/usr/local/bin）。

【讨论】：