在 R 中保存自动生成的图答案

【问题标题】：Save automatically produced plots in R在 R 中保存自动生成的图
【发布时间】：2019-06-06 12:40:03
【问题描述】：

我正在使用 R 中的一个函数来分析我的数据并生成多个图。

函数是来自adegenet 包的“snpzip”。

我想自动保存函数生成的三个图作为输出的一部分。你有什么建议吗？

我想指出一个事实，即我知道如何保存单个绘图，例如使用 png 或 pdf 后跟 dev.off()。我的问题是当我运行snpzip(snps, phen, method = "centroid") 时，结果是三个图（我想保存）。

我在这里报告与“adegenet”包中相同的示例：

simpop <- glSim(100, 10000, n.snp.struc = 10, grp.size = c(0.3,0.7), 
                LD = FALSE, alpha = 0.4, k = 4)
snps <- as.matrix(simpop)
phen <- simpop@pop

outcome <- snpzip(snps, phen, method = "centroid")

【问题讨论】：

不，它与那个帖子没有真正的关系。我知道如何在 R 中保存图。我的问题与此函数的输出结果为三个图有关，我无法保存。要理解我的意思，您可以运行我提供的脚本测试。
使用par(mfrow=c(1,3)) 或类似的方法将所有三个图放到一张图像中。

标签： r plot

【解决方案1】：

如果您使用的文件名中包含 C 整数格式，则 R 将用页码替换该部分名称，从而生成多个文件。例如，

png("page%d.png")
plot(1)
plot(2)
plot(3)
dev.off()

将生成 3 个文件，page1.png、page2.png 和 page3.png。对于pdf()，还需要onefile=FALSE：

pdf("page%d.pdf", onefile = FALSE)
plot(1)
plot(2)
plot(3)
dev.off()

【讨论】：