使用 NetworkX 向节点添加多级属性

Question

我正在尝试导出带有一些可视化规范的图形文件。我不知道如何添加多级属性。

Import networkx as nx
#Create the Graph 
g = nx.Graph()
g.add_edge('Andre',   'Beverly')
g.add_edge('Andre',   'Diane')
g.add_edge('Andre',   'Carol')
g.add_edge('Andre',   'Fernando')
g.add_edge('Beverly', 'Diane')
nx.draw(g)

为节点添加属性

我想做的是添加位置，但使用特定属性（名称和结构）

# compute position 
pos = nx.spring_layout(g)

# add attribute 
g.node["Andre"]["viz"]["position"]["x"]= pos["Andre"][0]
g.node["Andre"]["viz"]["position"]["y"]= pos["Andre"][1]

这不起作用

其实我有两个问题：

1. 如何添加多级属性
2. 有没有办法在迭代中做到这一点（我仍然可以写一个函数，但我想知道是否有办法从我没有见过的 networkx 做）

信息：我真正追求的是一种将网络图导出到 gexf 文件的方法，我可以用gexf-js 打开而不经过gephi.

P.S：我有 this question 和其他与此相关的信息，但据我所知，它们并没有解决我所追求的问题。

Answer 1

计算spring_layout()中的位置后：

for node in g.nodes():
    g.node[node]["viz"] = {'position': {'x': pos[node][0],
                                        'y': pos[node][1]
                                        }
                           }

print g.nodes(data=True)

结果：

[('Beverly',
  {'viz': {'position': {'x': 0.00089466691490215525,
     'y': 0.69872879243427066}}}),
 ('Andre',
  {'viz': {'position': {'x': 0.55837798068966304, 'y': 0.47862178288009244}}}),
 ('Carol', {'viz': {'position': {'x': 1.0, 'y': 0.95632397309056527}}}),
 ('Diane', {'viz': {'position': {'x': 0.0, 'y': 0.25644757276893704}}}),
 ('Fernando', {'viz': {'position': {'x': 0.9957995595107102, 'y': 0.0}}})]

然后你可以努力让nx.write_gexf(g, 'somefile.gexf') 工作:-)