将变量合并到 bash 代码行中答案

【问题标题】：Incorporate variables into bash code line将变量合并到 bash 代码行中
【发布时间】：2012-01-23 23:18:28
【问题描述】：

也许这不是最好的标题；但是仅用简短的标题很难传达我的意图。

我这里有一行：

2   118610455   P2_PM_2_5034    T   <DUP:TANDEM>    40  .   END=118610566;SVLEN=110;SVTYPE=TDUP;CIPOS=-100,55;CIEND=-56,100;IMPRECISE;DBVARID=esv7540;VALIDATED;VALMETHOD=CGH;SVMETHOD=RP

基本上我想把它转换成：

2 118610455 118610566

所以主要问题是从第 8 列 grep 这个118610566。

我知道如何 grep 这个数字：

$c=`cat line|awk '{print $8}'|sed 's/;/\t/g'|awk '{print $1}'|sed 's/\END=//g'`

但我的问题是如何将此变量合并到另一个 bash 行中：

what_i_want=`cat line|awk '{print $1"\t"$2"\t"$c}'`

谢谢

【问题讨论】：

标签： bash variables awk

【解决方案1】：

也许这会有所帮助 -

[jaypal:~/Temp] cat tmp
2   118610455   P2_PM_2_5034    T   <DUP:TANDEM>    40  .   END=118610566;SVLEN=110;SVTYPE=TDUP;CIPOS=-100,55;CIEND=-56,100;IMPRECISE;DBVARID=esv7540;VALIDATED;VALMETHOD=CGH;SVMETHOD=RP

[jaypal:~/Temp] var=$(awk -v FS="[ ;=]" '{print $1,$4,$24}' tmp)

[jaypal:~/Temp] echo $var
2 118610455 118610566

FS 是awk's 内置变量。它默认为空格或制表符。由于您的行作为多个分隔符，将FS 设置为字符类有助于为每个分隔符拆分行。我们在这里定义的字符类是space、semi-colon 或equal。

可能感觉有点奇怪，但当我碰巧解析超过 1 个分隔符的行时，我将它用作我的调试工具来识别列。这就是我从你的电话中得到的——

[jaypal:~/Temp] awk -v FS="[ ;=]" '{for(i=1;i<=NF;i++) print "$"i" is "$i}' tmp
$1 is 2
$2 is 
$3 is 
$4 is 118610455
$5 is 
$6 is 
$7 is P2_PM_2_5034
$8 is 
$9 is 
$10 is 
$11 is T
$12 is 
$13 is 
$14 is <DUP:TANDEM>
$15 is 
$16 is 
$17 is 
$18 is 40
$19 is 
$20 is .
$21 is 
$22 is 
$23 is END
$24 is 118610566
$25 is SVLEN
$26 is 110
$27 is SVTYPE
$28 is TDUP
$29 is CIPOS
$30 is -100,55
$31 is CIEND
$32 is -56,100
$33 is IMPRECISE
$34 is DBVARID
$35 is esv7540
$36 is VALIDATED
$37 is VALMETHOD
$38 is CGH
$39 is SVMETHOD
$40 is RP

你也可以通过下面的方式使用awk的一个简单的substr内置函数-

[jaypal:~/Temp] awk '{print $1,$2,$8=substr($8,5,9)}' tmp
2 118610455 118610566

【讨论】：

谢谢，但你能稍微解释一下 FS="[;=]" 吗？我不知道为什么 11861045 会变成第 4 列。

【解决方案2】：

只需一点点字符串操作，您就可以一次搞定。

what_i_want=$(awk '{sub(/^END=/,"",$8); sub(/;.*$/,"",$8); print $1,$2,$8}' line)

一些解释：

sub(a,b,c) 在变量c 中搜索模式a 并将其替换为b，将修改后的字符串存储回c。模式写在//。

^ 是字符串的开头，$ 是结尾，. 是任何东西，* 表示前面的模式的零个或多个。所以在我们的例子中：

sub(/^END=/,"",$8); 匹配字符串开头的END= (^) 并用"" 替换它，什么都没有，本质上是删除它。

sub(/;.*$/,"",$8); 将所有内容 (.*) 从 ; 带到末尾 ($) 并将其删除。请注意，在 awk 中，与大多数正则表达式引擎一样，* 是 greedy，这意味着它需要最长的匹配，所以我们知道这将获得第一个 ;。

剩下的就是你想要的号码。

【讨论】：

thx 效果很好......但是你能解释一下 sub(/;.*/,"",$8) 吗？我知道这里要截断之后的部分；正确的？但我不明白什么。和 * 在这里表示。

【解决方案3】：

如果你的“列”总是用空格分隔，那么你不需要使用 subshells 和 awk，你可以直接在 shell 中这样做：

[ghoti@pc ~]$ read one two three four five junk <<< "2   118610455   P2_PM_2_5034    T   <DUP:TANDEM>    40  .   END=118610566;SVLEN=110;SVTYPE=TDUP;CIPOS=-100,55;CIEND=-56,100;IMPRECISE;DBVARID=esv7540;VALIDATED;VALMETHOD=CGH;SVMETHOD=RP"
[ghoti@pc ~]$ echo "$five"
<DUP:TANDEM>
[ghoti@pc ~]$ echo "$junk"
40 . END=118610566;SVLEN=110;SVTYPE=TDUP;CIPOS=-100,55;CIEND=-56,100;IMPRECISE;DBVARID=esv7540;VALIDATED;VALMETHOD=CGH;SVMETHOD=RP

read 行上指定的最后一个变量将获得“其他所有内容”。

还有。如果你正在处理这样的多行，你可以循环运行它：

cat /path/to/inputfile | while read one two three four five junk; do
  echo "$one - $two - $five"
done

加盐调味。

【讨论】：