【发布时间】:2019-02-09 17:06:24
【问题描述】:
在下面的awk 中,我设置了一个loop 来读取特定类型的每个文件。下面的示例是两种类型的文件,但如果没有什么可计算的(file1 是一个示例),那么我没有得到任何输出。我正在尝试根据任一条件打印输出,如果没有0 打印在MAPD above QC Detected 前面。如果有什么要计算的,那么awk 会按预期执行,但我似乎无法正确调整它。这两个文件都是tab-delimited,... 代表被跳过的前三行。谢谢 :)。
awk
awk -F'\t' 'FNR == 3 {next}; $2 ~/MAPD>0.5/ {count++} END{print count " MAPD above QC Detected"}' file1 | awk '$1 == " MAPD above QC Detected" {print "0 MAPD above QC Detected"}'
文件1
....
....
....
chr1:1234 foo,bar
chr2:5678 foo,bar
文件2
....
....
....
chr1:1234 foo,MAPD>0.5
chr2:5678 foo,bar
想要的输出
文件1
0 MAPD above QC Detected
文件2
1 MAPD above QC Detected
【问题讨论】:
标签: awk