在列之间减去并使用 AWK 打印答案

【问题标题】：Substract between columns and print it with AWK在列之间减去并使用 AWK 打印
【发布时间】：2010-10-08 12:37:41
【问题描述】：

我有以下输入数据：

AATGCCACGTTGAGAGGCGTTCGCGGAAGGCGCG      44      40.000
AATGCCACTCGGGTCCGAGATGGCGGATCTCCAC      35      37.000
AATGCCAGAGCTGTGGTAGTGTGAAAGCAGCAGT      13      13.000

我想要做的是用第 2 列减去第 3 列产生：

AATGCCACGTTGAGAGGCGTTCGCGGAAGGCGCG      -4
AATGCCACTCGGGTCCGAGATGGCGGATCTCCAC      2
AATGCCAGAGCTGTGGTAGTGTGAAAGCAGCAGT      0

但是为什么这个 awk 不起作用：

 $ awk '{dif =($3 - $2)}END{print dif}' input.txt

【问题讨论】：

嘿，等一下，这是我的 DNA 副本（我认出了第二行的“CGAGATGGCGG”位）。你从哪里得到的？
你父母不是告诉过你是在开放 dna 序列许可下获释的吗？

标签： unix awk

【解决方案1】：

因为您只在最后打印出一次差异，这意味着除了最后一行之外的所有内容都被有效地丢弃了。（END 块只运行一次，当整个输入已被读取和处理）你想要这个代替：

awk 'NF > 0 { print $1 "\t" ($3 - $2) }' input.txt

NF > 0 防止 awk 为空行打印无意义的 0。

【讨论】：