用 ggplot 绘制 princomp 载荷答案

【问题标题】：Plotting princomp loadings with ggplot用 ggplot 绘制 princomp 载荷
【发布时间】：2018-01-28 04:17:22
【问题描述】：

我正在尝试对我的数据集进行 PCA 分析，我可以在基本绘图函数上绘制负载。但我想在 ggplot 上做这些，但我一直收到这个错误，“ggplot2 不知道如何处理类加载数据”。

我正在使用 princomp 函数，我正在绘制我的第一个组件与我的第二个组件。而且我需要根据与我正在执行 pca 的数据框具有相同行名的外部因素对其进行着色。我试图做与Tutorial with prcomp 相同的事情，但使用 pca$loadings，但它没有用。我需要在 ggplot 中绘制我的第一台 PC 和我的第二台 PC。

块引用

xy <- princomp(iris[,-5])
plot(xy$loadings[,"Comp.1"], xy$loadings[,"Comp.2"], col=iris$Species)
ggplot(xy, aes(x=xy$loadings[,1], y=xy$loadings[,2]))+geom_point()

【问题讨论】：

你太棒了！万分感谢！成功了！

标签： r ggplot2 pca princomp

【解决方案1】：

ggplot(as.data.frame(xy$loadings[,1:2]), aes(x=Comp.1, y=Comp.2))+geom_point()

【讨论】：