rmarkdown .rmd 文件中的 Rstudio 文件名补全答案

【问题标题】：Rstudio filename completion in rmarkdown .rmd filesrmarkdown .rmd 文件中的 Rstudio 文件名补全
【发布时间】：2018-02-22 00:34:07
【问题描述】：

在 Rstudio 版本 (1.0.143) 中。

我正在使用 Rstudio 包项目并在其中使用 Rmarkdown。所有代码文件都在 ./R 文件夹中。所有数据文件都在 ./Data 文件夹中。默认的getwd() 是父文件夹./（包含./R 和./Data）。

我使用 RStudio 中的文件补全工具，我认为它非常有用。但是在 .Rmd 文件中，它不能按预期工作。例如，这里有两种情况：

在 .R 文件中，包含在 ./R 文件夹中。我打开括号和相对于getwd()，完成工作符合预期文件夹，即父文件夹。因此 ./R 中的文件“hello.R”将完成为 "./R/hello.R"
在 .Rmd 文件中，也包含在 ./R 文件夹中。我开始一个 R 块。一世打开括号，完成后没有给我“./R” 文件夹，即使getwd() 给了父级“./”， ./R 中文件“hello.R”的补全给出“hello.R”。

这是已知的错误还是功能？

> sessionInfo() 
R version 3.4.1 (2017-06-30) Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit) Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1

Matrix products: default

locale: [1] LC_COLLATE=English_United States.1252  LC_CTYPE=English_United States.1252    LC_MONETARY=English_United States.1252 [4] LC_NUMERIC=C                           LC_TIME=English_United States.1252    

attached base packages: [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

loaded via a namespace (and not attached):  [1] Rcpp_0.12.12        compiler_3.4.1      RColorBrewer_1.1-2  plyr_1.8.4          base64enc_0.1-3     tools_3.4.1         rpart_4.1-11         [8] digest_0.6.12       evaluate_0.10.1     tibble_1.3.4        gtable_0.2.0        htmlTable_1.9       checkmate_1.8.3     lattice_0.20-35     [15] rlang_0.1.2         Matrix_1.2-11       gridExtra_2.2.1     stringr_1.2.0       cluster_2.0.6       knitr_1.17 htmlwidgets_0.9     [22] grid_3.4.1          nnet_7.3-12         data.table_1.10.4   survival_2.41-3     foreign_0.8-69      pacman_0.4.6        latticeExtra_0.6-28 [29] Formula_1.2-2       ggplot2_2.2.1       magrittr_1.5        Hmisc_4.0-3         scales_0.5.0        backports_1.1.0     htmltools_0.3.6     [36] splines_3.4.1       colorspace_1.3-2    stringi_1.1.5       acepack_1.4.1       lazyeval_0.2.0      munsell_0.4.3

【问题讨论】：

标签： r rstudio r-markdown

【解决方案1】：

RStudio 文件名补全基于当前工作目录，即您自己确定的getwd()。

编织 Rmd 文件时，将包含 Rmd 文件的目录用作工作目录。因此，当在./R 中找到您的 Rmd 文件时，这将成为您的工作目录。

最简单的解决方案是在开发 Rmd 文件时将工作目录更改为 ./R。

有一些选项供您调查。 RStudio 使用 rmarkdown 包中的render。参见例如?rmarkdown::render;看看knit_root_dir。这也适用于您的 knitr 文档

knit::opts_knit$set(root.dir='../')

编辑： 看起来 RStudio (v. 1.0.136) 足够聪明，可以识别 knitr 文档将基于其目录进行编织，因此使用 that 目录中的自动完成，而不是 getwd()。

【讨论】：

这就是我的想法，但在我的情况下它是不正确的。在 Rstudio 的包项目中，包含文件的主目录是“./R”，而 getwd() 文件夹是“./”。如果 .Rmd 在“./R”中，当我运行该块时，getwd() 文件夹是“./”。另外，当我编织它时，getwd() 文件夹也是“./”！只是完成被搞砸了。对于每个自动完成文件名，我必须添加“./R”，以便文件可以编织或运行所有块。我认为您所说的以前可能是真的，但现在不是我的 Rstudio 版本（1.0.143）——这很好。
在一个包项目中，getwd() 仍然可以是任何东西。 RStudio defaults 到包根目录。根据我的经验，RStudio 的文件完成基于getwd() 用于 R 文件，但对于 Rmd 文件，它基于 Rmd 文件的目录，而不考虑工作目录。
我按回车太快了，见编辑。让我尝试将我的 Rmd 文件移动到这些文件夹之一。也许那样我就不会有问题了。
有没有人找到解决这个问题的方法？我有一个 ./code 中的 Rmd 文档，但是通过开头块中的一行将它设置为根目录 (.)： knitr::opts_knit$set(root.dir = "../") 但是，当在 Rmd 文档中写入时分页查找文件时，即使控制台的工作目录设置为根目录，它仍然坚持从 ./code 目录开始。在 RStudio IDE 设置中以某种方式设置它会很好。
对不起，我之前的评论太仓促了。 “../”确实表示父目录。