R HTML 输出文件答案

【问题标题】：R HTML Output FileR HTML 输出文件
【发布时间】：2018-05-07 17:34:07
【问题描述】：

我正在使用 R 生成 HTML 报告输出，当我获得输出 html 文件并打开它时，我可以看到我使用 ggplot 创建的图表没问题，但是如果我将 html 文件发送给其他任何人，图表就会丢失并且它们只看文字。我的代码如下，任何关于我所缺少的建议都会很棒。

另外，我的本地驱动器中的图像未显示。

---
title: "title"
 ``author: 
- "X"
date: "`r format(Sys.time(), '%d %B %Y')`"
output: 
  html_document: 
 number_sections: yes
toc: yes
runtime: shiny    
---

```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = FALSE,message=FALSE, warning=FALSE)
```

{r libraries, include=FALSE} library(plyr) library(dplyr) library(tidyverse) library(ggplot2) library(forcats) library(reshape) library(png)

```{r, fig.width=12, fig.height=6, fig.align="center"}
# read in data file
lj= read.csv("LJ_Final.csv")  # read csv file

#rename variables to fit charts
names(lj)[names(lj) == "2015"] <- "15"

myvars <- c("HB","15")
newdatajoiner <- lj[myvars]

newdatajoiners.long<-melt(newdatajoiner,id.vars="HB")

aggdatajoiners <-aggregate(value ~ HB + variable, data = 
newdatajoiners.long, sum)

#plot the data
aggdatajoiners%>%
ggplot(aes(x=variable,y=value,fill=factor(HB)))+
 geom_bar(stat="identity",position="dodge")+
 labs(x="", y="")+
 theme_bw()+
 facet_wrap(~HB)
```
```{r,fig.align="center",out.width = "3000px"}
knitr::include_graphics('./tablefife.png')
```

【问题讨论】：

标签： html r shiny output r-markdown

【解决方案1】：

当你的 HTML 是从 Markdown 文件生成的时候，一个图片文件夹是用 HTML 生成的，你的图片被 HTML 引用，不包含在 html 文件本身中，你也需要发送这个文件夹。

您可以将图像转换为 base64 字符串并嵌入到 html 文件中，但是我不知道如何在 R 中自动执行此操作

【讨论】：

这已在另一个线程上解决：stackoverflow.com/questions/14870589/…
这是否意味着无法使用 markdown 在 HTML 输出中包含图像？
这里有，如果你使用命令行你需要使用上面链接中的base64参数，如果你使用RStudio，点击Knit旁边的齿轮，输出选项，高级和选中“创建独立的 HTML 文档”，图像现在应该嵌入为 base64 url
当我运行它时，图像会为我显示，但如果我共享 html 文件，则上面代码中的图表不会显示。即使我已经创建独立打勾

【解决方案2】：

@user3018495 另一个线程描述了如何排除图表。要在输出 HTML 文档中包含图表，请在 Rmd 输出选项中将 self_contained 设置为 yes 而不是 no。

---
title: "your title goes here"
output:
   html_document:
   self_contained: yes
   toc: yes
   toc_float: yes
---

如果您将 RStudio 与 knitr 一起使用，则在 RStudio 选项中进行配置。首先在代码编辑器窗口中选择齿轮。

接下来，选择Advanced 标签，然后

点击Standalone HTML
然后按“确定”。

当您编织文档时，生成的 HTML 文件将包含图表，如我在 Github 存储库中发布的 test HTML document 所示，以便可以通过 Github HTML 预览器查看。

问候，

镜头

【讨论】：