【发布时间】:2020-05-07 02:39:04
【问题描述】:
我正在尝试使用Aspera CLI 从European Nucleotide Archive (ENA) 下载数据,但是我的下载已停止。我之前使用相同的工具下载了几个文件,但这是自上个月以来发生的。我通常使用以下命令:
ascp -QT -P33001 -k 1 -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/ERR192/009/ERR1924229/ERR1924229.fastq.gz .
从Beta Science 的帖子中,我了解到这可能是由于没有限制下载速度,因此尝试使用-l 参数,但没有任何帮助。
ascp -QT -l 300m -P33001 -k 1 -i ~/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/ERR192/009/ERR1924229/ERR1924229.fastq.gz .
【问题讨论】:
标签: download ftp fastq ncbi rna-seq