在 read_file() 上的 Geopandas 警告

Question

我在使用 geopanda 的 read_file() 读取 geojson 时收到以下警告：

...geodataframe.py:422: RuntimeWarning: Sequential read of iterator was interrupted. Resetting iterator. This can negatively impact the performance.
  for feature in features_lst:

这是我使用的代码示例：

crime_gdf = gpd.read_file('datasets/crimes.geojson', bbox=bbox)

crimes.geojson 是一个包含大量点的文件，每个点都有一个“犯罪类型”

bbox 定义边界

代码按预期运行，但我不明白那个警告。

编辑

我将 geojson 转换为羽毛，我得到了同样的警告。

Answer 1

在 Fiona 的问题跟踪器中查看我的评论：https://github.com/Toblerity/Fiona/issues/986

GDAL（Fiona 用来访问地理数据的库）在当前读取的特征上维护一个迭代器。对于某些驱动程序，有一些操作会影响此迭代器。因此，在这些操作之后，我们必须确保将迭代器设置到正确的位置，以确保连续读取数据。此类操作包括对数据集中的所有特征进行计数，分别计算其范围。

GDAL 中有不同类型的驱动程序。有些驱动程序支持随机访问，有些则不支持。对于不支持随机访问的驱动程序，迭代器的重置涉及再次读取所有特征直到迭代器位置。由于这可能是一项代价高昂的操作，因此会发出此 RuntimeWarning，以便用户了解此行为。

Answer 2

我发现这个 fiona PR 引用了警告：https://github.com/Toblerity/Fiona/pull/965

在最近打开的Collection 上调用list(src) 时，我可以在fiona 1.8.18 上重现该问题，但在1.8.17 上则不行。所以我认为这是在 2020-11-17 发布的fiona 1.8.18 中引入的回归。

Answer 3

虽然在某些情况下忽略警告可能会导致问题，但我发现在我的代码输出中重复出现这个问题特别烦人。

我发现警告可以忽略使用

import warnings
# filter out RuntimeWarnings, due to geopandas/fiona read file spam
# https://stackoverflow.com/questions/64995369/geopandas-warning-on-read-file
warnings.filterwarnings("ignore",category=RuntimeWarning)

我在引用这篇文章的 cmets 中添加了解释我为什么要过滤掉这些警告的原因。如果在未来的 geopandas / fiona 版本中禁止此警告，则可能应该删除此代码 sn-p，因为它也可能禁止有意义的警告，并且在某些情况下可能会出现问题。