RMySQL 包不通过 JRI 接口加载答案

【问题标题】：RMySQL package doesn't load through JRI interfaceRMySQL 包不通过 JRI 接口加载
【发布时间】：2011-10-20 05:47:56
【问题描述】：

我已经设法在 R 中安装了 RMySQL，它运行良好（我还安装了它所需的依赖项 DBI，它也运行良好）。我正在构建一个通过 JRI 包与 R 交互的 java 应用程序（它也可以正常工作）。目前，我的应用程序查询 MySQL 数据库，将查询结果写入文件，并将这些文件加载到 R 中（通过使用 R 中的 load.csv() 函数）。但是，如果 R 直接与 MySQL 交互（因此是 RMySQL 包），程序会更有效地运行。我遇到的问题是，如果我尝试使用 Rengine.eval() JRI 函数加载 RMySQL 包，它将不会加载到 R 中。但是，Rengine.eval() 函数将加载我尝试加载的任何其他库。这是代码的sn-p：

Rengine re;

re.eval("library(\"DBI\")"); // this works, DBI will load
re.eval("library(\"RMySQL\")"); // this will not work, RMySQL fails to load

为了验证 RMySQL 加载失败，我这样做了：

REXP x;
System.out.println(x=re.eval("library(\"DBI\")"));
System.out.println(x=re.eval("library(\"RMySQL\")"));

我得到以下输出：

[STRING*（“DBI”、“stats”、“graphics”、“grDevices”、“utils”、“datasets”、“methods”、“base”）]

空

可以清楚地看到，第二个 println 命令返回 null，这意味着 RMySQL 无法加载（当然 RMySQL 函数也没有工作）。我不知道为什么会这样。

我不知道我做错了什么，但如果有人能告诉我问题出在哪里，或者是否有更好的方法通过 JRI 加载库，我将不胜感激。

请注意，我在 sparc-sun-solaris2.10 和 RMySQL_0.8-0 版本上使用 R 版本 2.13.0。

【问题讨论】：

标签： java r rmysql jri

【解决方案1】：

通过在运行 JRI 之前设置环境变量 R_HOME、R_INCLUDE_DIR、R_SHARE_DIR 和 R_DOC_DIR 解决了这个问题。现在效果很好。

【讨论】：

【解决方案2】：

我以前也遇到过这种问题。

你可能安装 RMySQL 包的方式不正确，例如

install.packages('RMySQL')

正确的方法是：

install.packages('RMySQL',type='source')

在我安装了类型为“source”的包后，我成功通过JRI加载了包。

【讨论】：