对 R 库提示自动响应“是”

Question

我正在努力定义一个 Docker 容器，它可以在云环境中启动，并在我们公司的数据库上运行一些报告并自行关闭，而我们的数据科学团队（包括我自己）尽可能少地参与其中。

我几乎已经完成了一切的启动和运行，除了一个令人恼火的异常——报告是在 R 中使用我们已经使用了几年的一些代码完成的。我在 Rocker verse 的基础上进行构建，并且正在添加需求库。

关于需求的烦人的事情（在这个用例中）是，当它第一次运行时，它会询问以下内容：

>library('needs')

Should `needs` load itself when it's... needed?   (this is recommended)

1: No
2: Yes

Selection:

在典型的交互式设置中，这很好，我只需输入“是”并按 Enter 即可。但是，当我希望整个环境每周自行构建和运行一次时，我不想回答这个问题。我希望它假设是。

到目前为止，我尝试过的包括以下各项：

library('needs', quiet=TRUE)
library('needs', quietly=TRUE)
suppressMessages(library('needs', quietly=TRUE))
suppressWarnings(suppressMessages(library('needs', quietly = T)))
suppressPackageStartupMessages(library('needs', quietly=TRUE))

这些都不能解决问题。 needs documentation 提供了以后以编程方式更改此设置，但不适用于定义第一次运行需要时的设置：

推荐使用是让函数在提示时自动加载 第一次以交互方式加载包。更改此设置 稍后，运行 needs:::autoload(TRUE) 或 needs:::autoload(FALSE) 转 分别开启或关闭自动加载。

我也试过悄悄安装需求，也无济于事。不幸的是，我无法在我的 Dockerfile 中运行 bash 命令来响应 Yes，或者至少我还没有找到方法。

我想避免因需要而删除依赖项，因为这将涉及大量代码重构。

关于如何解决这个问题的任何想法？

谢谢！ :] -文斯

更新

解决方案有点老套，但在我的 Dockerfile 中，我正在对需要分配给 sysfile 变量的文件进行 vim 编辑：

sysfile <- system.file("extdata", "promptUser", package = "needs")

对我来说是 /usr/local/lib/R/site-library/needs/extdata/promptUser，并将其内容从“1”更改为“0”解决了我的问题。

Answer 1

一个更好的解决方案可能是让它不首先提出问题。你可以在 github 上查看它在包加载时运行的代码：https://github.com/cran/needs/blob/master/R/needs-package.R

如果您事先设置了它检查的选项，那么它不需要首先提出问题：

options(needs.promptUser = FALSE)