【问题标题】:cluster genetic programming/algorithms集群遗传编程/算法
【发布时间】:2011-12-23 01:02:03
【问题描述】:

最近我一直在尝试了解 hadoop 集群是否可以用于遗传算法/编程工作。我一直在阅读有关 hadoop 的内容,并且我知道它可以并行处理大型数据集。在我的情况下,我不会有大型数据集.. 但我会发现真正有用的是 hadoop 的并行化功能。所以,我的问题是,像 hadoop 这样的程序是否可以用于评估或处理我认为更面向处理而不是面向 I/O 的遗传算法/编程?

【问题讨论】:

  • 可能没人有兴趣回答这个问题吗?

标签: hadoop cluster-computing genetic-algorithm


【解决方案1】:

如您所知,最大的生物信息学算法基于组合、切割、拼接、编辑距离、神经网络等以及像 dfs 一样的回溯(用于部分摘要)。如果您让它们像 map-reduce 一样分布特定实例或长度 ex 的工作:

For length 1 ..... map-reduce job 1
For length 2 ..... map-reduce job 2
.
.
.
For length n ..... map-reduce job n

或者,如果您想将 Bio-info 算法与 hadoop 的架构进行比较,您可以在此链接中找到简单的算法 >>http://matrixsust.blogspot.com/2011/01/introduction-to-bioinformatics.html

希望对你有帮助。

【讨论】:

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