Evolving Creatures - 使用由我自己创建的复杂类的实例构建的个体创建遗传算法

Question

我正在开展一个项目，我正在尝试实施由 Karl Sims 撰写的“不断进化的虚拟生物”理念。

问题在于，在我读过的每个教程中，他们都是从整数或布尔值构建个体，如下所示：

pop.subpop.0.species        = ec.vector.BitVectorSpecies
pop.subpop.0.species.ind    = ec.vector.BitVectorIndividual

但是如果我有一个名为“Node”的类，它比这些更复杂吗？没有这样的 ec.vector.BitVectorNode。 在 ECJ 教程页面 (http://cs.gmu.edu/~eclab/projects/ecj/docs/) 中，有一个名为“教程后讨论”的教程，其中写了以下内容：

任意表示 使用 ECJ 进行任意表示相当容易。只需将个人子类化并添加您自己的表示。您可能需要制作自己的 BreedingPipelines，它知道如何跨越或改变您的表示。

我的类节点扩展了个人，但我不知道如何继续或我必须对公共代码应用哪些更改才能创建群体（例如教程 1 和 2 中的代码）

这是它的属性声明：

public class Node extends Individual
{
/** Properties */
private static final long serialVersionUID = -4771047292470201612L;
private double length;
private double width;
private double height;
private int recLimit;
private Joint joint;
private Set<Sensor> setSensors = new HashSet<Sensor>();
private Set<Neuron> setNeurons = new HashSet<Neuron>();
private Set<Effector> setEffectors = new HashSet<Effector>();
private Set<Connection> setConnections = new HashSet<Connection>();

//And then the methods

任何帮助将不胜感激。

Answer 1

教程 1 和 2 是如何使用 ECJ 包来定义和解决遗传算法问题的示例，而不是遗传编程（两者之间的区别see here）。

在遗传算法中，您必须将您的问题“编码”成某种基因组，位或整数是教程 1 和 2 所示的常见编码表示，因此您必须找到一种方法从您的 @ 实例中提取此基因组987654325@ 类（你的人口）来编码问题。只是为了超级清楚，换句话说，您的节点类必须有一个 getGenome 方法，或者您需要一些其他对象来封装编码逻辑，并且可以查看您的 Node 实例并知道如何提取基因组。

如果您尝试改进类本身（从您的问题中不完全清楚），教程 4 将展示如何使用遗传编程包。如果你真正想做的是使用这个包“进化代码”（遗传编程），那么你应该参考这个教程。