【发布时间】:2012-04-04 04:27:29
【问题描述】:
我在 biotoolbox 包中运行了一个 perl 脚本。(http://code.google.com/p/biotoolbox/) 但收到与 jarfile 相关的错误消息。
$./bar2wig.pl
This program will convert bar files to a wig file
Usage:
bar2wig.pl [--options...] <filename>
Options:
--in <filename> or <directory>
--out <filename>
$ ./bar2wig.pl --in /Users/biotoolbox/scripts/ --out example
This program will convert bar files to a wig file
checking input file(s)....
converting to gr files...
Unable to access jarfile /usr/local/USeq/Apps/Bar2Gr
writing wig file...
cleaning up temp files... done
我不确定如何处理错误:无法访问 jarfile。 它看起来像 java 相关的错误,虽然这个脚本是 perl。
有这方面的 cmets 吗?
【问题讨论】:
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应用程序很可能反过来使用 java JAR 文件来完成工作。您是否按照code.google.com/p/biotoolbox/wiki/BioToolBoxSetUp 中概述的整个设置步骤进行操作