Gdata包perl问题答案

【问题标题】：Gdata package perl issueGdata包perl问题
【发布时间】：2012-06-12 00:05:50
【问题描述】：

我正在尝试按照这个简单的 2 分钟视频教程将 Excel 电子表格作为数据框导入 R：http://www.screenr.com/QiN8

我遵循了每个步骤，包括在我的 Win 7 PC 上下载和安装 Strawberry Perl（32 位），将 R 指向我的工作目录，然后在 R 中输入以下命令：

Spreadsheet <- read.xls("targetspreadsheet.xls")

我收到此错误：

findPerl 中的错误（详细 = 详细）：找不到 perl 可执行文件。使用 perl= 参数来指定正确的路径。 file.exists(tfn) 中的错误：“文件”参数无效

更新：

我重置了我的机器并将路径设置为 Perl：

perl <- "C:/strawberry/perl/bin/perl.exe"

然后我输入了这个命令：

DF <- read.xls("spreadsheet.xls", perl = perl)

命令行返回此错误：

xls2sep 中的错误（xls, sheet, verbose = verbose, ..., method = method, : 缺少中间文件“C:\Users\AEID\AppData\Local\Temp\RtmpoXMywa\file18e45ed513c.csv”！另外：警告信息：运行命令 '"C:\STRAWB~1\perl\bin\perl.exe" "C:/Users/AEID/Documents/R/win-library/2.15/gdata/perl/xls2csv.pl" "GFT_show_wip_report(42) .xls" "C:\Users\AEID\AppData\Local\Temp\RtmpoXMywa\file18e45ed513c.csv" "1"' 状态为 2 file.exists(tfn) 中的错误：“文件”参数无效

我做错了什么？

提前感谢您的帮助！

AME

【问题讨论】：

Perl 必须在您的PATH 上。在命令提示符下检查PATH，如果自安装 Perl 后没有重新启动 R，请重新启动它。
@mob - 你能详细说明我如何检查 PATH 吗？
安装 perl 后你是否重启过机器？
待命。我正在向 YouTube 上传一段 90 秒的视频，介绍如何在 Windows 7 上检查 PATH。
要么确保 perl 在你的路径上，要么使用 perl= 参数告诉它 perl 的位置。例如perl <- "C:/Perl/bin/perl.exe"; DF <- read.xls("myfile.xls", perl = perl) 。根据您实际安装 perl 的位置进行修改。

标签： perl excel r

【解决方案1】：

我也遇到了同样的问题，并且已经与“xls2sep 中的错误”斗争了 1 个小时。重新安装草莓，不行。

我终于发现excel文件坏了。 “xls2sep 中的错误”似乎意味着文件已损坏。

宁

【讨论】：

【解决方案2】：

使用library(gdata) 加载gdata 包后，它清楚地说：

gdata：read.xls() 将无法读取 Excel XLS 和 XLSX 文件 gdata：除非 'perl=' 参数用于指定一个 gdata：有效的 perl 解释器。

因此，您需要有效的 perl 解释器的 PATH。使用 windows，就像这里的情况一样，您需要检查属性以找到所需的 perl 解释器。

#set the PATH to perl interpreter
perl <- "C:/strawberry/perl/bin/perl5.18.2.exe"

try1file <- read.xls("my.one.filename.xls", perl = perl)

对于多个 xls 文件：

> length(list.files())
[1] 65

try65files <- lapply(list.files(), ..., perl = perl)

如果verbose = TRUE，则在每个文件的末尾会显示：

Loading 'F65.xls'...
Done.
Orignal Filename: F65.xls
Number of Sheets: 1
Writing sheet number 1 ('Sheet1') to file 'C:\Users\FRANKL~1.JOH\AppData\Local\Temp\RtmpeKs3fi\file13dc750950e4.csv'
Minrow=0 Maxrow=32 Mincol=0 Maxcol=16
  (Ignored 0 blank lines.)
0 
Done.
Reading csv file  “C:\Users\FRANKL~1.JOH\AppData\Local\Temp\RtmpeKs3fi\file13dc750950e4.csv” ...
Done.

【讨论】：

我想指出，@Igor Krupitsky 提供了一种指向有效 perl 解释器的永久方式，而不是每次需要导入 excel 文件时都指定它。请参阅下面的答案。我会编辑这个答案添加这个

【解决方案3】：

你可以试试这个语法：

T<-read.xls("Template.xlsx", perl = "C:\\Perl\\bin\\perl.exe")

我在这里找到了这个解决方案

http://cran.r-project.org/web/packages/gdata/INSTALL

【讨论】：

【解决方案4】：

我自己遇到了这个问题，终于找到了罪魁祸首。在我的初始代码中，我正在处理一个有 4 张纸的 excel 文件，并且在第 4 张纸上进行操作- read.xls(con, perl=prl, sheet=4)。我的新 xlxs 文件有一张，导致错误。

【讨论】：

【解决方案5】：

正如其他一些答案所说，问题是缺少 perl.exe。就我而言，它在从以下位置安装后起作用： http://www.activestate.com/activeperl/downloads 然后指向它：

    read.xls("bla.xlsx", perl = "C:\\Perl64\\bin\\perl.exe")

【讨论】：

【解决方案6】：

R 正在搜索 xls 或 xlsx 文件，但没有找到。因此，设置您的 Excel 文件所在的工作目录（例如setwd("C:\....")）并运行以下任何脚本格式：

read.xls("Potato.xls", perl = "C:\\Strawberry\\perl\\bin\\perl.exe")
read.xls("Tomato.xls", perl = "C:\\Strawberry\\perl\\bin\\perl.exe")
read.xls("Potato.xlsx", perl = "C:/Strawberry/perl/bin/perl.exe")
read.xls("Tomato.xlsx", perl = "C:/Strawberry/perl/bin/perl.exe")

【讨论】：

【解决方案7】：

确保您的路径变量未命名为“perl”。我将其重命名为 prl 并成功！

这不起作用：

perl <- "C:/Strawberry/perl/bin/perl.exe"
excel_gdata <- read.xls(url_xls, perl)

Error in findPerl(verbose = verbose) : 
  perl executable not found. Use perl= argument to specify the correct path.
Error in file.exists(tfn) : invalid 'file' argument

这行得通！

prl <- "C:/Strawberry/perl/bin/perl.exe"
excel_gdata <- read.xls(url_xls, prl)

【讨论】：

【解决方案8】：

在我运行以下脚本并重新启动 PC 后，问题就消失了：

library(gdata)
installXLSXsupport(perl = 'C:\\strawberry\\perl\\bin\\perl.exe')

【讨论】：

【解决方案9】：

就我而言，我收到了类似的消息：

Error in xls2sep(xls, sheet, verbose = verbose, ..., method = method,  : 
  Intermediate file 'C:\Users\dddd\AppData\Local\Temp\Rtmp6DG4Cr\file1ce018647411.csv' missing!
In addition: Warning message:
running command '"C:\Perl64\bin\PERL52~1.EXE" "C:/Users/dddd/Documents/R/win-library/3.4/gdata/perl/xls2csv.pl"  "D:/dddd/mlj/Results/xxxx.xlsx" "C:\Users\dddd\AppData\Local\Temp\Rtmp6DG4Cr\file1ce018647411.csv" "1"' had status 13 
Error in file.exists(tfn) : invalid 'file' argument

我通过关闭Excel表格想出了解决办法，Excel和R不能同时打开。

【讨论】：

【解决方案10】：

我最近在Windows 10下使用gdata包和Strawberry Perl软件遇到了同样的问题。我的解决方案如下：（1）卸载旧版本的Strawberry Perl - 如果您尝试安装新版本超过旧版本，它说它不可升级，（2）安装从link下载到C:/Strawberry/的新版本，（3）将C:/Strawberry/perl/bin/perl.exe添加到环境的用户变量中的“路径”变量窗口。

【讨论】：