无法在 IBM Watson Studio R 环境笔记本上安装 CRAN 包“viridis”、“Hmisc”答案

【问题标题】：Can not install the CRAN packages "viridis", "Hmisc" on IBM Watson Studio R Environment Notebooks无法在 IBM Watson Studio R 环境笔记本上安装 CRAN 包“viridis”、“Hmisc”
【发布时间】：2018-08-10 01:40:42
【问题描述】：

我正在尝试在 IBM Watson Studio 上的 R 环境笔记本中安装 CRAN Hmisc 包。但它反复失败并出现以下错误：

install.packages('Hmisc')

also installing the dependencies ‘checkmate’, ‘rstudioapi’, ‘Formula’, ‘latticeExtra’, ‘acepack’, ‘gridExtra’, ‘htmlTable’, ‘viridis’

Warning message in install.packages("Hmisc"):
“installation of package ‘viridis’ had non-zero exit status”Warning message in install.packages("Hmisc"):
“installation of package ‘Hmisc’ had non-zero exit status”Updating HTML index of packages in '.Library'
Making 'packages.html' ... done

我尝试单独安装 viridis 包，但同样失败：

install.packages('viridis')

Warning message in install.packages("viridis"):
“installation of package ‘viridis’ had non-zero exit status”Updating HTML index of packages in '.Library'
Making 'packages.html' ... done

【问题讨论】：

标签： r jupyter-notebook cran hmisc watson-studio

【解决方案1】：

我所做的是使用devtools 下载库的一个版本：

require(devtools)
install_version('Hmisc',  version = "4.1-0")

然后我又安装了：

install.package('Hmisc')

然后您可以加载库 library('Hmisc') 并运行 sessionInfo() 以查看您正在运行最新版本。这是一种解决方法，我不知道为什么它最初不想安装。也许它与使用版本 3.3.2 的 DSX 中的 R 有关，并且缺少某些库？我一点头绪都没有。

【讨论】：

DSX 环境笔记本上的 R 版本是 3.4.2。查看sessionInfo() 的输出。
看来真正的问题在于安装viridis 而不是Hmisc。相应地更新问题
我签出了sessionInfo()，否则我会说3.4.2。我的是 R 版本 3.3.2 (2016-10-31)。
您确定您使用的是 R-Environment 笔记本（它是一项新功能）而不是 Spark Service R 笔记本吗？

【解决方案2】：

结果证明viridis 的依赖管理不正确。它依赖于viridisLite >= 0.2.0。最新的viridis 期待一个名为cividis 的对象，该对象仅添加到最新版本的viridisLite > 0.2.0 中。 DSX 已安装 viridisLite==0.2.0。因此，viridis 的安装失败。所以基本上，显式安装更新版本的viridisLite 可以解决问题。

install.packages(c('viridisLite', 'Hmisc'))

TL;DR - 安装最新的viridisLite，然后安装Hmisc

【讨论】：