【问题标题】:How can I plot AUC and ROC while using fit_generator and evaluate_generator to train my network?如何在使用 fit_generator 和 evaluate_generator 训练我的网络时绘制 AUC 和 ROC?
【发布时间】:2019-05-02 05:55:48
【问题描述】:

我正在使用生成器来训练和预测我的数据的分类。这是ImageDataGenerator的示例

from keras.preprocessing.image import ImageDataGenerator

batch_size = 16

train_datagen = ImageDataGenerator(
        rescale=1./255,
        shear_range=0.2,
        zoom_range=0.2,
        horizontal_flip=True)

test_datagen = ImageDataGenerator(rescale=1./255)


train_generator = train_datagen.flow_from_directory(
        'data/train',  # this is the target directory
        target_size=(150, 150),  
        batch_size=batch_size,
        class_mode='binary') 

validation_generator = test_datagen.flow_from_directory(
        'data/validation',
        target_size=(150, 150),
        batch_size=batch_size,
        class_mode='binary')
       

model.fit_generator(
        train_generator,
        steps_per_epoch=2000 // batch_size,
        epochs=50,
        validation_data=validation_generator,
        validation_steps=800 // batch_size)
model.save_weights('first_try.h5')  # always save your weights after training or during training

我的问题是当我使用fit_generator 时如何创建AUC and ROC

【问题讨论】:

  • 使用标准 sklearn 的 roc 和 auc 功能有什么问题?
  • @Julien 我在使用生成器时该怎么做?
  • 你试过什么?不知道是什么问题...
  • @Julien,坦率地说,我不确定如何将sklearn.metrics.roc_auc_score 与生成器一起使用。

标签: python tensorflow scikit-learn keras


【解决方案1】:

我认为在这种情况下您最好的选择是将 AUC 定义为一个新指标。为此,您必须在 tensorflow 中定义指标(我假设您使用的是 tensorflow 后端)。

我之前尝试过的一种方法(但是,我不记得我测试过结果的正确性)是这样的:

def as_keras_metric(method):
    """
    This is taken from:
    https://stackoverflow.com/questions/45947351/how-to-use-tensorflow-metrics-in-keras/50527423#50527423
    """
    @functools.wraps(method)
    def wrapper(*args, **kwargs):
        """ Wrapper for turning tensorflow metrics into keras metrics """
        value, update_op = method(*args, **kwargs)
        tf.keras.backend.get_session().run(tf.local_variables_initializer())
        with tf.control_dependencies([update_op]):
            value = tf.identity(value)
        return value
    return wrapper

然后在编译模型时定义度量:

model.compile(metrics=['accuracy', as_keras_metric(tf.metrics.auc)], optimizer='adam', loss='categorical_crossentropy')

虽然这会吐出数字,但我还没有确定它们是否正确。如果您能够对此进行测试,并且它给出了正确的结果,请告诉我,我很想知道。

解决此问题的第二种方法是使用callback class 并至少定义on_epoch_end 函数,然后您可以从那里调用sklearn roc_auc_score 并打印输出或保存到日志.

但是,到目前为止,我发现,您需要通过__init__ 为其提供训练数据,因此对于生成器,您需要确保回调的生成器提供与模型拟合相同的数据发电机。另一方面,对于验证生成器,可以使用self.validation_data 从回调类中访问它,这与提供给fit_generator 的方法相同。

【讨论】:

  • 如何在回调函数中访问与模型拟合生成器相同的数据?我只是不知道细节。您可以为此添加一个示例吗?谢谢,
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