为什么 Git 不为初始提交暂存一些“修改过的”文件夹？

Question

我从备份 tarball 中收到了修改后的旧版本 ERPNext 的代码，我想将此代码添加到我的 Ubuntu 笔记本电脑上的本地 Git 存储库中，以便我可以跟踪更改，直到我的雇主可以托管远程存储库。假设备份已经在~/backup/erpnext/ 中提取，我正在尝试设置我的 Git 存储库以进行如下初始提交：

cd ~
mkdir erpnext
cd erpnext
cp -r ~/backup/erpnext/* ./
git init
git add *

我认为，这应该将备份中的所有文件和文件夹添加到~/erpnext 目录，并将它们全部暂存以进行初始提交。但是，为了确保一切按预期工作，我在提交之前运行了git status，并收到了以下输出：

On branch master

Initial commit

Changes to be committed:
  (use "git rm --cached <file>..." to unstage)

    new file:   app
    new file:   conf.py
    new file:   conf.pyc
    new file:   erpnext-backup.log
    new file:   erpnext-sch.log
    new file:   lib
    new file:   public/app
    new file:   public/app.html
    new file:   public/css/all-app.css
    new file:   public/css/all-web.css
    new file:   public/js/all-app.min.js
    new file:   public/js/all-web.min.js
    new file:   public/js/editor.min.js
    new file:   public/js/slickgrid.min.js
    new file:   public/lib
    new file:   scheduler.lock

Changes not staged for commit:
  (use "git add <file>..." to update what will be committed)
  (use "git checkout -- <file>..." to discard changes in working directory)
  (commit or discard the untracked or modified content in submodules)

    modified:   app (modified content, untracked content)
    modified:   lib (modified content, untracked content)

让我吃惊的是app 和lib（它们都是文件夹）被标记为具有修改的内容，并且没有准备提交。我尝试在*、app 和lib 上运行git add --force，但它似乎没有任何改变。

我不想提交我的代码并将这些文件夹从存储库中排除。我该如何解决这个问题？

Answer 1

删除这些子文件夹中的所有.git/ 目录。 他们可能会混淆git（有关更多信息，请参阅git submodules）。

（顺便说一句，您可以保留任何 .gitignore 文件，因为它们有望帮助忽略特定于这些文件夹的临时文件）。

这是一个方便的命令，可以删除~/erpnext（但不是~/erpnext/.git）的任何子目录中的所有.git 目录：

 find ~/erpnext/ -depth -mindepth 2 -type d -name .git -exec rm -rf \{\} \;

或者，如果您的上游项目已经是一个 git 存储库（带有子模块），您可能只想保留原始历史记录，继续使用原始 VCS：

cd ~
rm -rf erpnext
cp -r ~/backup/erpnext .
cd erpnext
git log