通过 RPostgreSQL 建立数据库连接时 R 崩溃答案

【问题标题】：R crashes when establishing a database connection via RPostgreSQL通过 RPostgreSQL 建立数据库连接时 R 崩溃
【发布时间】：2018-09-21 18:15:35
【问题描述】：

我正在使用如下所示的 R 版本：

R version 3.4.3 (2017-11-30) -- "Kite-Eating Tree"
Copyright (C) 2017 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-apple-darwin15.6.0 (64-bit)

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[R.app GUI 1.70 (7463) x86_64-apple-darwin15.6.0]

我使用的是 macOS Sierra 版本 10.12.6 (16G1314)。使用 3.1 GHz Intel Core i7 处理器，内存 16 GB 1867 MHz DDR3，显卡是 Intel Iris Graphics 6100 1536 MB。

这是我崩溃的 R 代码。出于安全原因，我删除了主机名、端口、数据库名称、用户名和密码。 con 分配是崩溃的原因。我正在尝试使用组织内的代码示例连接到 Redshift 集群。

library(RPostgreSQL)
drv <- dbDriver("PostgreSQL")
con <- dbConnect(
    drv,
    host = "<host name>",
    port = "<four digit port>"
    dbname = "'dbname = <database name> ssl=require'",
    user = "<user name>",
    password = "<password>"
)

这是我在分配 con 之前的 R 会话信息

R version 3.4.3 (2017-11-30)
Platform: x86_64-apple-darwin15.6.0 (64-bit)
Running under: macOS Sierra 10.12.6

Matrix products: default
BLAS: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/lib/libRblas.0.dylib
LAPACK: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/lib/libRlapack.dylib

locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods  
[7] base     

other attached packages:
[1] RPostgreSQL_0.6-2 DBI_0.8          

loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.4.3

这是崩溃报告，出于安全原因删除了一些内容：

 *** caught segfault ***
address 0x0, cause 'memory not mapped'

Traceback:
 1: .Call(RS_PostgreSQL_newConnection, drvId, con.params)
 2: postgresqlNewConnection(drv, ...)
 3: dbConnect(drv, host = "<hostname>", port = "<port>",     dbname = "'dbname = <database name> ssl=require'", user = "<user name>",     password = "<password>")
 4: dbConnect(drv, host = "<hostname>", port = "<port>",     dbname = "'dbname = <database name> ssl=require'", user = "<user name>",     password = "<password>")

Possible actions:
1: abort (with core dump, if enabled)
2: normal R exit
3: exit R without saving workspace
4: exit R saving workspace

我已经用两个 Redshift 集群尝试过，但遇到了同样的问题。

问题：如何解决此问题，以便通过 R 连接到我的 Redshift 集群？

额外问题：是我自己还是最近 R 版本有问题？

【问题讨论】：

把它作为一个答案。然后我会测试它，如果它有效，请检查你的答案

标签： r segmentation-fault rpostgresql

【解决方案1】：

我迅速搜索并浏览了 Amazon 文档中的 Redshift。他们建议您使用 JDBC 或 ODBC 驱动程序。 RPostgreSQL 包使用 libpq 驱动程序，所以我不希望它与 Redshift 一起使用。

我建议您使用RODBC、RJDBC 或odbc，具体取决于哪个最适合您的设置。

【讨论】：