RDotNet 与 R 脚本答案

【问题标题】：RDotNet vs R scriptingRDotNet 与 R 脚本
【发布时间】：2013-08-06 00:31:30
【问题描述】：

什么时候使用 RDotNet 进行统计计算而不是生成 R 脚本文本文件并使用例如从应用程序运行它是一种优势/劣势。进程.开始？还是有其他更好的方法？

我需要执行大量的命令，感觉将它们一个一个发送到R需要很多时间。

【问题讨论】：

标签： c# r scripting r.net

【解决方案1】：

我想说以下两种情况是典型的：

.NET 代码和 R 代码是完全分开的，R 代码和 .NET 代码之间不需要太多交互。例如，.NET 代码收集一些信息，并在其上启动一个处理脚本，之后 .NET 代码获取结果。在这种情况下，生成一个 R 进程 (Process.Start) 是实现此功能的一种简单方法。
.NET 代码和 R 代码之间需要大量交互，工作流包括经常在 .NET 和 R 之间来回切换。在这种情况下，像 RDotNet 这样重量更重、更灵活的解决方案就很有意义了。 RDotNet 允许更轻松地集成 .NET 代码和 R 代码，其代价是它通常更难学习、更难调试，并且经常需要针对新版本的 R 等进行更新。

【讨论】：

【解决方案2】：

使用 Process.Start 您将启动一个新的 R 会话。这可能需要一些时间，尤其是当您在脚本中使用需要加载的不同包时。

如果你使用 R.NET，你可以创建一个 R 实例，并继续与之对话。因此，如果您创建了一个将 R 与 ASP 连接起来的 Web 服务，您就不想一直启动 R，因为这将非常耗时。您只需要它一次，就可以交互式地使用它。

【讨论】：

【解决方案3】：

R.NET 目前可以初始化一次。并行执行会有问题。

建议使用 RScript。

我们的解决方案基于stackoverflow上的这个答案Call R (programming language) from .net

随着单声道变化，我们从字符串发送 R 代码并将其保存到临时文件，因为用户在需要时运行自定义 R 代码。

public static void RunFromCmd(string batch, params string[] args)
{
    // Not required. But our R scripts use allmost all CPU resources if run multiple instances
    lock (typeof(REngineRunner))
    {
        string file = string.Empty;
        string result = string.Empty;
        try
        {
            // Save R code to temp file
            file = TempFileHelper.CreateTmpFile();
            using (var streamWriter = new StreamWriter(new FileStream(file, FileMode.Open, FileAccess.Write)))
            {
                streamWriter.Write(batch);
            }

            // Get path to R
            var rCore = Registry.LocalMachine.OpenSubKey(@"SOFTWARE\R-core") ??
                        Registry.CurrentUser.OpenSubKey(@"SOFTWARE\R-core");
            var is64Bit = Environment.Is64BitProcess;
            if (rCore != null)
            {
                var r = rCore.OpenSubKey(is64Bit ? "R64" : "R");
                var installPath = (string)r.GetValue("InstallPath");
                var binPath = Path.Combine(installPath, "bin");
                binPath = Path.Combine(binPath, is64Bit ? "x64" : "i386");
                binPath = Path.Combine(binPath, "Rscript");
                string strCmdLine = @"/c """ + binPath + @""" " + file;
                if (args.Any())
                {
                    strCmdLine += " " + string.Join(" ", args);
                }
                var info = new ProcessStartInfo("cmd", strCmdLine);
                info.RedirectStandardInput = false;
                info.RedirectStandardOutput = true;
                info.UseShellExecute = false;
                info.CreateNoWindow = true;
                using (var proc = new Process())
                {
                    proc.StartInfo = info;
                    proc.Start();
                    result = proc.StandardOutput.ReadToEnd();
                }
            }
            else
            {
                result += "R-Core not found in registry";
            }
            Console.WriteLine(result);
        }
        catch (Exception ex)
        {
            throw new Exception("R failed to compute. Output: " + result, ex);
        }
        finally
        {
            if (!string.IsNullOrWhiteSpace(file))
            {
                TempFileHelper.DeleteTmpFile(file, false);
            }
        }
    }
}

完整博文：http://kostylizm.blogspot.ru/2014/05/run-r-code-from-c-sharp.html

【讨论】：