使用 sed（或其他命令行）将一组字符替换为不同的字符集答案

【问题标题】：Use sed (or other command line) to replace a set of characters with a different set使用 sed（或其他命令行）将一组字符替换为不同的字符集
【发布时间】：2011-03-30 06:03:29
【问题描述】：

我需要通过将所有 A 更改为 T、T 更改为 A、C->G 和 G->C 来反转 DNA 文本字符串。

我可以在 sed（或其他命令行）中优雅地处理此问题，而无需一整条 sed 全局替换命令链吗？

【问题讨论】：

@OMG Ponies sed 如果运行该命令的用户具有编辑权限并且您使用“-i”开关进行就地编辑，则可以更改源。

标签： command-line sed

【解决方案1】：

这就是你使用 sed 的方式

$ echo "test ATCG GATC test" | sed 'y/ATCG/TAGC/'
test TAGC CTAG test

【讨论】：

有趣，不知道 sed 的 y 选项

【解决方案2】：

使用 tr。
猫文件 | tr ATCG TAGC

【讨论】：

哦，太好了，这正是我想要的。我最初有一个解决方案，我将所有 A 和 G 更改为其他字符（X 和 Y），然后再通过一次，我将所有内容都更改回来，但这似乎很愚蠢。感谢您的帮助。
优越得多？并不真地。和UUOC。 tr ATCG TAGC < file