hdbscan 问题（ValueError：numpy.ndarray 大小已更改，可能表示二进制不兼容。预期 C 标头为 88，从 PyObject 获得 80）答案

【问题标题】：Issue with hdbscan (ValueError: numpy.ndarray size changed, may indicate binary incompatibility. Expected 88 from C header, got 80 from PyObject)hdbscan 问题（ValueError：numpy.ndarray 大小已更改，可能表示二进制不兼容。预期 C 标头为 88，从 PyObject 获得 80）
【发布时间】：2021-06-14 09:29:06
【问题描述】：

我知道很多人之前已经发布过这个问题，但我仍然无法解决我的错误。我正在尝试导入 hdbscan 但它一直返回以下错误

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ValueError                                Traceback (most recent call last)
<ipython-input-12-bf3184c2d1a0> in <module>
      2 import numpy as np
      3 from pyproj import Transformer
----> 4 import hdbscan
      5 from scipy.spatial.qhull import ConvexHull
      6 from shapely.geometry import Point

~/Library/Python/3.7/lib/python/site-packages/hdbscan/__init__.py in <module>
----> 1 from .hdbscan_ import HDBSCAN, hdbscan
      2 from .robust_single_linkage_ import RobustSingleLinkage, robust_single_linkage
      3 from .validity import validity_index
      4 from .prediction import (approximate_predict,
      5                          membership_vector,

~/Library/Python/3.7/lib/python/site-packages/hdbscan/hdbscan_.py in <module>
     19 from scipy.sparse import csgraph
     20 
---> 21 from ._hdbscan_linkage import (single_linkage,
     22                                mst_linkage_core,
     23                                mst_linkage_core_vector,

hdbscan/_hdbscan_linkage.pyx in init hdbscan._hdbscan_linkage()

ValueError: numpy.ndarray size changed, may indicate binary incompatibility. Expected 88 from C header, got 80 from PyObject

我已尝试卸载 numpy 1.19.5 并安装 numpy 1.20，但它对我不起作用。我已经安装了包 hdbscan 0.8.27，我使用的是 Python 3.7.2，但我没有 MacBook 的管理员权限。感谢任何帮助！

【问题讨论】：

更改 hdbscan 或 numpy 版本对我也不起作用。 This issue 可能会有所帮助，因为您无法更改 python 版本。如果有，请告诉我！
在我最后的尝试中，我尝试卸载 numpy 1.19.5 并安装 numpy 1.20.0，但不知何故这次成功了。我正在开发一个 Jupyter 笔记本，并且在我之前的尝试中一直使用它，但是这一次，我在安装 NumPy 1.20.0 后刚刚重新启动了 Jupyter 笔记本并且它工作了......虽然不知道这是怎么发生的。

标签： python numpy jupyter-notebook hdbscan

【解决方案1】：

我遇到了同样的问题。

我使用以下方法安装了 hdbscan：

!pip install hdbscan --no-build-isolation --no-binary :all:

还安装了numpy 1.9.2

它对我有用。

【讨论】：