IFS 不仅仅是 R 脚本和 bash 的字符用法答案

【问题标题】：IFS more than a character usage with R script and bashIFS 不仅仅是 R 脚本和 bash 的字符用法
【发布时间】：2011-11-04 10:32:48
【问题描述】：

我正在使用 bash 脚本编写和运行 R 脚本：因为我不精通 RI，所以我曾经在 bash 脚本中编写循环和条件，然后在 R 脚本或“这里的文档”中进行翻译......就像你可以想象以这种方式生成的 R_scripts 变得非常长且难以阅读......所以我学习了如何用 R 编写循环和条件，但我发现命令 system() 有几个困难，所以我意识到 shell 脚本是如果我不想因为引用和转义而发疯的话，某种程度上是必要的...... ;-) 我遇到的第一个问题是：我想声明一个像这样的变量Rarr="file_1", "file_2", "file_3"ecc 因为我想把它插入到R_script中

cat>my_R_script.R<<EOF
my_arr<-c(${Rarr})
do something with my_arr
EOF

需要引号，因为如果没有引用 file_names，R 会提示您找不到名为 file_names 的对象

我尝试遵循comma separated elements of array 中的第一个解决方案定义IFS="" ,"" 但似乎当 Rarr="${arr[*]}";echo "${Rarr}" 的元素仅由 ${IFS} 的第一个字符分隔时...在我的情况下，它们将由 " 分隔有没有办法避免这种情况？

所以基本上我的问题是：如何强制 shell 考虑 ${IFS} 中的所有字符？

无论如何，我找到了两个解决我的问题的方法.. 第一个

arr=($(ls -1 | tail))
new_IFS="\" ,\""
Rarr=${arr[0]}
for ((i=1;i<${#arr[@]};i++))
do 
    Rarr="${Rarr}${new_IFS}${arr[$i]}"
    #echo "${Rarr}"
done;
Rarr=\""${Rarr}"\"
#echo ${Rarr}

还有一个参数替换...但我想知道是否存在直接解决我的问题的方法

提前感谢您的帮助

【问题讨论】：

您能否简化您的描述并提供一个示例。我觉得很难解决你的问题。
你为什么要通过 bash 做这些（编写脚本和执行脚本）？为什么您认为有必要动态更改 R 脚本的内容？这确实不是使用 any 可脚本化工具的方式，无论是 R、MatLab、numpy 等。
嗨，Carl，我想采用这种方式，因为我必须对许多不同的系统进行相同的分析。所以我使用 bash 生成 R 脚本，然后，一旦 bash 脚本生成了脚本，我就使用 R CMD BATCH name_of_R_script 运行它
嗨 Mu 基本上我在问为什么发布 here 的解决方案在我的情况下不起作用：有没有办法强制 IFS 超过一个字符？
在这种情况下，为什么不编写一个调用 vi 或 emacs 进行编辑的 bash 脚本呢？

标签： bash r scripting ifs

【解决方案1】：

使用标准 IFS 将 Rarr 简单定义为 Rarr="\"file_1\" \"file_2\" \"file_3\"" 怎么样？

【讨论】：

这是不可能的，因为我不想输入数组的成员，这些都是命令的结果

【解决方案2】：

如果我们没有空格（我们不需要）：

#!/bin/bash
arr=(${arr[*]/#/\"})            # prepend quotes
arr=(${arr[*]/%/\"})            # append quotes
IFS=, eval 'Rarr="${arr[*]}"'   # join by commas

（注意：arr 已修改）。

【讨论】：