【发布时间】:2020-12-03 23:10:48
【问题描述】:
我正在尝试执行一个合并染色体数据的命令。因为我需要合并来自染色体 1..22 和 X 和 Y 的数据,所以我想看看是否有更好的方法来做到这一点。我可以在下面提供myfile.list 来合并染色体数据。
plink1.9 --bfile --merge-list myfile.list --make-bed --out mymerged
myfile.list 是一个文本文件,其中包含:
data.chr1.b
data.chr2.b
...
...
data.chr22.b
data.chrX.b
data.chrY.b
我不想提供一个文本文件myfile.list,而是想在这个命令中使用一个包含所有数据名称的变量。这样做的更好方法是什么?像这样?
plink1.9 --bfile --merge-list cat `echo "data.chr"{1..22}. X. Y.` --make-bed --out mymerged
【问题讨论】:
标签: linux bash shell unix command-line