python子进程答案

【问题标题】：python sub-processpython子进程
【发布时间】：2010-11-17 01:13:41
【问题描述】：

我通常在 Linux 中（手动）执行一个 Fortran 文件：

连接到服务器
转到特定文件夹
ifort xxx.for -o xxx && ./xxx（其中 'xxx.for' 是我的 Fortran 文件，'xxx' 是 Fortran 可执行文件）

但我需要从 python 调用我的 fortran 文件 (xxx.for)（我是初学者），所以我使用 subprocess 和以下命令：

cmd = ["ssh", sshConnect, "cd %s;"%(workDir), Fortrancmd %s jobname "%s -o  %s" exeFilename "%s && %s ./ %s%s"%(exeFilename)]

但我收到一个错误，我不确定出了什么问题。完整代码如下：

import string
import subprocess as subProc
from subprocess import Popen as ProcOpen
from subprocess import PIPE
import numpy
import subprocess

userID = "pear"
serverName = "say4"
workDir = "/home/pear/2/W/fortran/"
Fortrancmd = "ifort"
jobname = "rad.for"
exeFilename = "rad"

sshConnect=userID+"@"+servername

cmd=["ssh", sshConnect, "cd %s;"%(workDir), Fortrancmd %s jobname "%s -o  %s" exeFilename "%s && %s ./ %s%s"%(exeFilename)]

**#command to execute fortran files in Linux
**#ifort <filename>.for -o <filename> && ./<filename> (press enter)

**#example:ifort xxx.for -o xxx && ./xxx (press enter)

print cmd

如何编写一个 python 程序来执行上述所有 3 个步骤并避免我遇到的错误？

【问题讨论】：

标签： python ssh subprocess

【解决方案1】：

有一些语法错误...

原文：

cmd=["ssh", sshConnect, "cd %s;"%(workDir), Fortrancmd %s jobname "%s -o  %s" exeFilename "%s && %s ./ %s%s"%(exeFilename)]

我想你的意思是：

cmd = [
      "ssh",
      sshConnect,
      "cd %s;" % (workDir,),
      "%s %s -o  %s && ./%s" % (Fortrancmd, jobname, exeFilename, exeFilename)
      ]

几点说明：

具有一个元素的元组需要在第一个参数（workDir,）的末尾加上逗号才能被解释为元组（与简单的操作顺序括号相比）
使用单个字符串格式操作构建您的 fortan 命令可能更容易

PS - 为了可读性，将长列表分成多行通常是个好主意:)

我的建议

我建议查看this stackoverflow thread for ssh 而不是使用子进程

【讨论】：

【解决方案2】：

对于手册部分，您可能需要查看 pexpect 或 Windows wexpect。这些允许您在交互条件下执行子流程并传递输入。

但是，您所做的大部分工作听起来都可以在 shell 脚本中正常运行。为简单起见，您可以在服务器端为您的服务器端操作制作一个 shell 脚本，然后在 ssh 语句中插入路径：

ssh user@host "/path/to/script.sh"

【讨论】：

【解决方案3】：

一个错误：
您的 args 列表中有一个未加引号的 %s，因此您的字符串格式化将失败。

【讨论】：

【解决方案4】：

这是一个完整的例子，使用 subprocess 模块通过 ssh 运行远程命令（在本例中为简单的 echo）并获取结果，希望对您有所帮助：

>>> import subprocess
>>> proc = subprocess.Popen(("ssh", "remoteuser@host", "echo", "1"), stdout=subprocess.PIPE, stderr=subprocess.PIPE)
>>> stdout, stderr = proc.communicate()

在这种情况下返回：('1\n', '')

请注意，要使其在不需要密码的情况下工作，您可能必须将本地用户的公钥添加到远程计算机上的 ~remoteuser/.ssh/authorized_keys。

【讨论】：

【解决方案5】：

您可以在第 1 步和第 2 步中使用 fabric。这是基本思想：

from fabric.api import *
env.hosts = ['host']
dir = '/home/...'

def compile(file):
     with cd(dir):
         run("ifort %s.for -o %s" %(file,file))
         run("./%s > stdout.txt" % file)

创建 fabfile.py
然后你运行fab compile:filename

【讨论】：

【解决方案6】：

一定要用python吗？

ssh user@host "命令"

【讨论】：