【发布时间】:2020-03-25 17:57:38
【问题描述】:
我正在尝试实现一个简单的MPI 程序,在该程序中我调用一个函数foo(),-n 进程在该函数上传递n 数组,直到所有数组都传递给所有进程(n steps)。该实现采用环形通信的形式,process#0 发送到process#2 并从process#n-1 等接收。这是我的代码:
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <mpi.h>
void foo(double* X, int n,int d,int k)
{
int id, world_size;
double *array = X;
double *array_buff = malloc(n*d*sizeof(double));
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &id);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &world_size);
MPI_Status status;
array[0] = id;
for(int step = 0 ; step < world_size ; step++)
{
int temp = id-step;
if(temp<0)
{
temp = world_size+temp;
}
if(array[0]!= temp)
{
printf("[%d][%d] %f (start)\n", id, step, array[0]);
}
//even processes send first while odd process receive
//first in order to avoid deadlock - achieve synchronization
MPI_Request reqsend, reqrecv;
int dst = (id+1)%world_size;
if(id%2 == 0)
{
int src = id-1;
if(id == 0)
{
src = world_size-1;
}
MPI_Isend(array, n*d, MPI_DOUBLE, dst, 0, MPI_COMM_WORLD, &reqsend);
MPI_Irecv(array_buff, n*d, MPI_DOUBLE, src, 0, MPI_COMM_WORLD, &reqrecv);
}
else
{
MPI_Irecv(array_buff, n*d, MPI_DOUBLE, id-1, 0, MPI_COMM_WORLD, &reqrecv);
MPI_Isend(array, n*d, MPI_DOUBLE, dst, 0, MPI_COMM_WORLD, &reqsend);
}
//..some array[] related work is been done here...
if(array[0]!=temp)
{
printf("[%d][%d] %f (end)\n", id, step, array[0]);
}
//update array asynchronously
MPI_Wait(&reqrecv, &status);
array = array_buff;
}
free(array);
}
为了避免死锁偶数进程先发送后接收,而奇数进程先接收后发送。
初始化:array[0] = id;旨在控制通信是否正确完成。这就是为什么我使用两个打印,一个在开始,一个在函数结束,以观察 array[] 是否在 array = array_buff; 分配(其中array[] 获取缓冲值)发生之前更改内容。
我得到的输出之一是:
[0][2] 1.000000 (start)
[0][2] 1.000000 (end)
[0][3] 0.000000 (start)
[0][3] 0.000000 (end)
[1][3] 1.000000 (start)
[1][3] 1.000000 (end)
[3][1] 1.000000 (end)
[3][2] 0.000000 (end)
[3][3] 3.000000 (end)
为什么array[] 的内容在array_buff[] 赋值之前被改变了?
注意:我已经读到,在某些 MPI 版本中,在发送完成之前不能使用 array[](Isend() 缓冲区)。但我认为情况并非如此,因为即使我在 Isend() Irecv() 段之后根本不使用 array[],程序行为仍然是一样的。
我尝试设置 标签 以匹配每个特定的发送,使用标识符值是 step value,但我遇到了死锁,我不明白为什么.我将不胜感激。
tag = step;
【问题讨论】:
标签: c asynchronous buffer mpi send