【发布时间】:2017-02-02 20:07:53
【问题描述】:
我正在构建一个具有因子变量但数字条目的模型。我将它们转换为数字。当我尝试使用 SVM 径向内核构建模型时,我收到了一些我不理解的奇怪消息。下面是我所做的。
Subset of data
class ac_000 ad_000 ag_007
neg 2130706438 280 25896
neg 228 100 292936
pos 42328 856 51190
neg 24 24 0
neg 370 346 0
pos 1534 1388 794698
factorconvert <- function(f){as.numeric(levels(f))[f]}
DF[, 2:4] <- lapply(DF[, 2:4], factorconvert)
SVM
ctrl<-trainControl(method="repeatedcv"),
repeats=5,
summaryFunction=twoClassSummary,
classProbs=TRUE)
Train and Tune the SVM
svm.tune <- train(x=trainX, y= trainData$Class,method = "svmRadial",
tuneLength = 9, preProc =c("center","scale"),metric="ROC",trControl=ctrl)
Error in if (any(co)) { : missing value where TRUE/FALSE needed In
addition: Warning message: In FUN(newX[, i], ...) : NAs introduced by
coercion.
any(is.any(DF)).
我还使用 na.omit() 删除了数据中的所有 NA。 我重新检查了数据。不存在缺失值。我需要帮助。
【问题讨论】:
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请至少包含您的数据子集,以使您的问题可重现。没有它,很难帮助你。看看help center。谢谢!
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实际数据的大小是多少?
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1.检查您的因子转换的结果。它可能无法正常工作。它不适用于您提供的数据。 2. 输入你的一些原始数据。这套太小了,无法测试。如果您不想使用您的数据,请尝试使用 GermanCredit 数据(包含在 caret 包中)或其他一些数据集来复制错误。
标签: r machine-learning svm r-caret