【发布时间】:2018-02-24 00:25:15
【问题描述】:
我对 R 中的 gradDescent package 有一个理解问题。假设我有一个包含一个自变量的数据集,我想对这个数据运行一个简单的线性回归,并使用批处理估计模型及其参数梯度下降(GD)算法。
例如,我正在使用here 中给出的数据集。第一列是自变量(X),第二列是因变量(Y)。
我为批量梯度下降算法编写了自己的 R 代码。我使用的学习率为 0.01,迭代次数为 1500。估计模型为 y = -3.630291 + 1.166362 x。参数的初始值都选择为1。
我还想检查我的代码是否正常工作。我使用 R 内置函数 lm 包进行比较。参数与R中线性回归函数给出的结果非常接近。所以在这种情况下,我们的梯度下降算法得到的线性回归模型是y=-3.896 + 1.193 x。
但是,最近,我发现了一个 R 包 gradDescent,我想看看它是如何工作的。使用相同的学习率和最大迭代次数,我得到了模型 y=-1.229567+0.9257195x 的结果(这些值在我每次运行时都会发生变化,因为我设置了 seed=NULL)。
GD <- function(dataTrain, alpha=0.1, maxIter=10, seed=NULL){
#convert data.frame dataSet in matrix
dataTrain <- matrix(unlist(dataTrain), ncol=ncol(dataTrain), byrow=FALSE)
#shuffle data train
set.seed(seed)
dataTrain <- dataTrain[sample(nrow(dataTrain)), ]
set.seed(NULL)
#initialize theta
theta <- getTheta(ncol(dataTrain), seed=seed)
#bind 1 column to dataTrain
dataTrain <- cbind(1, dataTrain)
#parse dataTrain into input and output
inputData <- dataTrain[,1:ncol(dataTrain)-1]
outputData <- dataTrain[,ncol(dataTrain)]
#temporary variables
temporaryTheta <- matrix(ncol=length(theta), nrow=1)
updateRule <- matrix(0, ncol=length(theta), nrow=1)
#constant variables
rowLength <- nrow(dataTrain)
#loop the gradient descent
for(iteration in 1:maxIter){
error <- (inputData %*% t(theta)) - outputData
for(column in 1:length(theta)){
term <- error * inputData[,column]
#calculate gradient
gradient <- sum(term) / rowLength
updateRule[1,column] <- updateRule[1,column] + (alpha*gradient)
temporaryTheta[1,column] = theta[1,column] - updateRule[1,column]
}
#update all theta in the current iteration
theta <- temporaryTheta
}
result <- theta
return(result)
}
这里,getTheta 函数为,
getTheta <- function(columnLength, minTheta=0, maxTheta=1, seed=NULL){
#create static random
set.seed(seed)
#random a value
thetaList <- runif(columnLength, min=minTheta, max=maxTheta)
#clear static random
set.seed(seed)
#transform into matrix
result <- matrix(unlist(thetaList), ncol=columnLength, nrow=1, byrow=FALSE)
return(result)
}
包随机选择初始值。此外,它会在运行 GD 算法之前对数据进行混洗。我玩了一会儿。我将参数的初始值分配为 1 并停止对数据进行混洗。但是我无法认真理解哪里出了问题(或正确),原因是我不能用我自己的 GD 代码和 R 的 lm 函数得到相同的结果。请有人解释一下吗?
install.packages("gradDescent")
library(gradDescent)
URL_subs <-"https://raw.githubusercontent.com/ahawker/machine-learning-coursera/master/ex1/ex1data1.txt"
data <- read.table(URL_subs, header=FALSE, sep=",")
########## gradDescent Function ##########
GD(data, alpha = 0.01, maxIter = 1500, seed = NULL)
# [,1] [,2]
#[1,] -1.312882 0.9281769
########## R bulit-in function ##########
model <- lm(data$V2~ ., data = data)
model
#Call:
# lm(formula = data$V2 ~ ., data = data)
#
#Coefficients:
# (Intercept) V1
# -3.896 1.193
注意:我可以提供我写的内容,但基本上,我试图理解为什么这个包比 lm 包提供更多不同的参数估计。
编辑: 是因为代码中的那一行吗?
updateRule[1,column] <- updateRule[1,column] + (alpha*gradient)
当第二个循环 (for(column in 1:length(theta))) 结束时,代码不会重置 updateRule 矩阵,而是不断将 (alpha*gradient) 添加到每次迭代中的矩阵。我错了吗?
当我在迭代中找到参数更新后将此 updateRule 矩阵重置为零时,我得到的模型 y = -3.570819 +1.160388 x 非常接近我所拥有的和 lm 包提供的模型。
编辑 2 我原来的帖子中提到了那个 gradDescent 包有什么问题。 updateRule 矩阵没有被重置。我只是在循环中添加了一行代码,并没有更改任何其他内容。 getTheta 和 GD 函数与发布包的作者相同。
我举两个例子来纠正它。我使用的第一个数据集带有一个自变量,第二个数据集带有两个自变量。对于这两个示例,我都使用随机生成的首字母缩写,这是包中的想法。对于第二个示例,我将数据归一化,因为输入变量的数量级不同。房屋面积(大小)大约是卧室数量的 1000 倍。
示例 1
URL_subs <-"https://raw.githubusercontent.com/ahawker/machine-learning-coursera/master/ex1/ex1data1.txt"
data <- read.table(URL_subs, header=FALSE, sep=",")
getTheta <- function(columnLength, minTheta=0, maxTheta=1, seed=NULL){
#create static random
set.seed(seed)
#random a value
thetaList <- runif(columnLength, min=minTheta, max=maxTheta)
#clear static random
set.seed(seed)
#transform into matrix
result <- matrix(unlist(thetaList), ncol=columnLength, nrow=1, byrow=FALSE)
return(result)
}
GD <- function(dataTrain, alpha=0.1, maxIter=10, seed=NULL){
#convert data.frame dataSet in matrix
dataTrain <- matrix(unlist(dataTrain), ncol=ncol(dataTrain), byrow=FALSE)
#shuffle data train
set.seed(seed)
dataTrain <- dataTrain[sample(nrow(dataTrain)), ]
set.seed(NULL)
#initialize theta
theta <- getTheta(ncol(dataTrain), seed=seed)
#bind 1 column to dataTrain
dataTrain <- cbind(1, dataTrain)
#parse dataTrain into input and output
inputData <- dataTrain[,1:ncol(dataTrain)-1]
outputData <- dataTrain[,ncol(dataTrain)]
#temporary variables
temporaryTheta <- matrix(ncol=length(theta), nrow=1)
updateRule <- matrix(0, ncol=length(theta), nrow=1)
#constant variables
rowLength <- nrow(dataTrain)
#loop the gradient descent
for(iteration in 1:maxIter){
error <- (inputData %*% t(theta)) - outputData
for(column in 1:length(theta)){
term <- error * inputData[,column]
#calculate gradient
gradient <- sum(term) / rowLength
updateRule[1,column] <- updateRule[1,column] + (alpha*gradient)
temporaryTheta[1,column] = theta[1,column] - updateRule[1,column]
}
updateRule <- matrix(0, ncol=length(theta), nrow=1)
#update all theta in the current iteration
theta <- temporaryTheta
}
result <- theta
return(result)
}
GD(data, alpha = 0.01, maxIter = 1500, seed = NULL)
# [,1] [,2]
#[1,] -3.602297 1.16355
########## R built-in lm function ##########
model <- lm(data$V2~ ., data = data)
model
#Call:
# lm(formula = data$V2 ~ ., data = data)
#
#Coefficients:
# (Intercept) V1
# -3.896 1.193
示例 2
data <- read.csv("https://raw.githubusercontent.com/ethen8181/machine-learning/master/linear_regression/housing.txt",
header = TRUE,
sep = "," )
getTheta <- function(columnLength, minTheta=0, maxTheta=1, seed=NULL){
#create static random
set.seed(seed)
#random a value
thetaList <- runif(columnLength, min=minTheta, max=maxTheta)
#clear static random
set.seed(seed)
#transform into matrix
result <- matrix(unlist(thetaList), ncol=columnLength, nrow=1, byrow=FALSE)
return(result)
}
GD <- function(dataTrain, alpha=0.1, maxIter=10, seed=NULL){
#convert data.frame dataSet in matrix
dataTrain <- matrix(unlist(dataTrain), ncol=ncol(dataTrain), byrow=FALSE)
#shuffle data train
set.seed(seed)
dataTrain <- dataTrain[sample(nrow(dataTrain)), ]
set.seed(NULL)
#initialize theta
theta <- getTheta(ncol(dataTrain), seed=seed)
#bind 1 column to dataTrain
dataTrain <- cbind(1, dataTrain)
#parse dataTrain into input and output
inputData <- dataTrain[,1:ncol(dataTrain)-1]
outputData <- dataTrain[,ncol(dataTrain)]
#temporary variables
temporaryTheta <- matrix(ncol=length(theta), nrow=1)
updateRule <- matrix(0, ncol=length(theta), nrow=1)
#constant variables
rowLength <- nrow(dataTrain)
#loop the gradient descent
for(iteration in 1:maxIter){
error <- (inputData %*% t(theta)) - outputData
for(column in 1:length(theta)){
term <- error * inputData[,column]
#calculate gradient
gradient <- sum(term) / rowLength
updateRule[1,column] <- updateRule[1,column] + (alpha*gradient)
temporaryTheta[1,column] = theta[1,column] - updateRule[1,column]
}
updateRule <- matrix(0, ncol=length(theta), nrow=1)
#update all theta in the current iteration
theta <- temporaryTheta
}
result <- theta
return(result)
}
GD(data, alpha = 0.05, maxIter = 500, seed = NULL)
# [,1] [,2] [,3]
#[1,] 340412.7 110630 -6648.375
########## R built-in lm function ##########
housing <- read.csv("https://raw.githubusercontent.com/ethen8181/machine-learning/master/linear_regression/housing.txt",
header = TRUE,
sep = "," )
normalized <- apply(housing[ , -3 ], 2, scale)
normalized_data <- data.frame(cbind(normalized, price = housing$price))
model <- lm( price ~ ., data = normalized_data)
model
#Call:
# lm(formula = price ~ ., data = normalized_data)
#
#Coefficients:
# (Intercept) area bedrooms
# 340413 110631 -6649
【问题讨论】:
标签: r algorithm package lm gradient-descent