JRI - 如何定位 R 中的错​​误

Question

所以基本上，我使用的是 Java、JRI（Java 的 R）和 RJDBC（在 JRI 的帮助下），它们都运行得很好。 现在，我想让我的程序尽可能地万无一失。假设，字符串 SQL_command 是某种垃圾，并不是真正有效的 SQL 语句。那样的话……

    re.eval("sql_data <- dbGetQuery(conn, \"" + SQL_command + "\")");

...应该出错了。 我的想法是这样的：如果 R 命令失败，R 中会有某种输出。如果一切正确，则没有输出。但是我怎样才能捕捉到可能的输出呢？

请记住，我的问题更多是关于如何捕获无效的 R 语句，因此对于可能的解决方案的任何其他建议也表示赞赏。 R 输出不一定重要，但无论如何它可能很有趣。

提前致谢！

Answer 1

我建议直接在 R 中捕获由于 R 代码引起的（可能的）异常。因此，如果我怀疑某个命令可能会出错，我会在 R 中使用 try 函数。沿着这个行：

       REXP y = re.eval("sql_data <- try(dbGetQuery(conn, \"" + SQL_command + "\"),silent=TRUE)");
       REXP x = re.eval("class(sql_data)");
       if ((x.asString()).equals("try-error")) {
          System.out.println(y.asString());
          // do something to catch the exception
       } else {
         // do normal stuff
       }

这样你也可以显示R错误。

这里有一点可重现的（除了数据库凭据）代码，它首先尝试执行有效的查询语句，然后是无效的。

      import java.io.*;
      import org.rosuda.JRI.*;
      public class Prova {
         public static void main(String[] args) {
           String[] commands = {"a<-try(dbGetQuery(conn,'show tables'))","a<-try(dbGetQuery(conn,'SS'))"};
           Rengine re=new Rengine (new String [] {"--vanilla"}, false, null);
           re.eval("require(RMySQL)");
           re.eval("conn<-dbConnect(MySQL(),user='xxx',password='xxx',dbname='xxx')");
           for (int i=0;i<2;i++) {
             REXP y = re.eval(commands[i]);
             REXP x = re.eval("class(a)");
             if ((x.asString()).equals("try-error")) {
               System.out.println(y.asString());
             } else {
               System.out.println(x.asString());
             }
           }
           re.end();
         }
      }

输出：

   data.frame
   Error in mysqlExecStatement(conn, statement, ...) : 
     RS-DBI driver: (could not run statement: You have an error in your SQL syntax; check the manual that corresponds to your MySQL server version for the right syntax to use near 'SS' at line 1)

Answer 2

根据the documentation for the org.rosuda.JRI.Rengine.eval(String) method，如果出现问题，将返回null。该方法不会抛出任何类型的Exception，因此它似乎没有提供任何确定问题原因的方法。

org.rosuda.REngine.parseAndEval(String) method 确实抛出了几个 Exception 类型，REngineException 和 REXPMismatchException，这可能会提供更多的失败解释，但文档并不清楚究竟为什么以及何时会抛出这些。

因此，您可以做的最好的事情可能是检查 null 返回值。