R：pROC 包：在特定范围内绘制 ROC 曲线？答案

【问题标题】：R: pROC package: plot ROC curve across specific range?R：pROC 包：在特定范围内绘制 ROC 曲线？
【发布时间】：2019-11-02 14:11:13
【问题描述】：

我想在 x 值的特定范围内绘制 ROC 曲线的一部分，而不是绘制整个曲线。我不想改变 x 轴本身的范围。我只想在我指定的 x 值范围内绘制 ROC 曲线的一部分。

library(pROC)
data(aSAH)
rocobj <- roc(aSAH$outcome, aSAH$wfns)
plot(rocobj)

该代码绘制了整个 ROC 曲线。假设我只想绘制从 x=1 到 x=.5 的曲线。我怎么能那样做？谢谢。

【问题讨论】：

你想通过绘制它来实现什么？一种方法是使用1-rocobj$specificities、rocobj$sensitivities
我有形成经验 ROC 的数据，应该只扩展到数据中存在的最小特异性。但是 pROC 将 ROC 曲线沿对角线向上延伸。我有这个：link 但我希望它不绘制正确的部分。我认为 Dylan 解决方案的一个变体会起作用。
任何数据集中存在的最小特异性为 0。您始终可以在 -infinity 处设置一个阈值，并将所有否定分类为误报。

【解决方案1】：

roc 对象的默认绘图函数将 rocobj$ 灵敏度绘制为 rocobj$specificities 的函数。

所以

plot(rocobj$specificities,rocobj$sensitivities,type="l",xlim=c(1.5,-0.5))
abline(1,-1)

达到与

相同的效果

plot(rocobj)

和

plot(rocobj$specificities[2:6],rocobj$sensitivities[2:6],type="l",xlim=c(1.5,-0.5),ylim=c(0,1))
abline(1,-1)

接近我认为你所追求的（从 0.514 到 1.0 的图）。我对包了解得不够多，不知道是否可以在特定范围内计算灵敏度或特异性分辨率。

【讨论】：

【解决方案2】：

pROC 的 plot 函数使用通常的 R 语义进行绘图，因此您可以像处理任何其他绘图一样使用 xlim 参数：

plot(rocobj, xlim = c(1, .5))

【讨论】：