在 python 中绘制图形 - pydotplus 错误答案

【问题标题】：Drawing graphs in python - pydotplus error在 python 中绘制图形 - pydotplus 错误
【发布时间】：2018-03-29 10:12:27
【问题描述】：

我迷失在所有用于绘制图形的python 库中。我希望我知道一个灵活且有文档的...

我花了很多时间玩 networkx，发现它对我的任务不太好（例如，为更大的图重叠标签）。

现在，我正在尝试使用 pydot 或 pydotplus，但没有文档，也没有合理的示例。还是我错过了什么？ Pydotplus 网站提供了参考，但对初学者来说并不完全有帮助。

现在，我可以使用 pydotplus 绘制图形，但我想更改节点位置（Fruchterman-Reingold 算法），尤其是对节点使用颜色和大小，但我不知道怎么做。

示例代码：

import pydotplus as ptp

graph = ptp.Dot(graph_type='graph')
edges = [(1,2), (1,3), (2,4), (2,5), (3,5)]
nodes = [(1, "A", "r"), (2, "B", "g"), (3, "C", "g"), (4, "D", "r"), (5, "E", "g")]
for e in edges:
    graph.add_edge(ptp.Edge(e[0], e[1]))
for n in nodes:
    node = ptp.Node(name=n[0], attrs={'label': n[1], 'fillcolor': n[2]} )
    graph.add_node(node)
graph.write_png("file.png")

这会引发异常：

InvocationException: Program terminated with status: 1. stderr follows: 
Error: /tmp/tmpznciMx: syntax error in line 7 near '{'

【问题讨论】：

哪个最好？一个基于意见的问题，如果我见过的话。
@asongtoruin：我已经指定了我关心的参数。
你应该阅读help center和How to Ask
对不起，我对此感到非常沮丧；我已经更改了标题并指定了问题。问题是我不关心我使用哪个库； pydotplus 似乎是最好的选择，但它不起作用。 pydotplus 中出现语法错误。我不知道人们用什么来绘制图表。我想知道什么是已知的。
@Reti43：我相信这个例子符合标准。如帖子中所述，我想用彩色节点绘制图表。

标签： python networkx graphviz pydot

【解决方案1】：

问题解决了，感谢@pgv。

问题 1：节点参数需要作为 key=value 对而不是 dict 传递
issue 2：fillcolor 本身不起作用，参数样式必须设置为“filled”

更正的代码：

import pydotplus as ptp

graph = ptp.Dot(graph_type='graph')
edges = [(1,2), (1,3), (2,4), (2,5), (3,5)]
nodes = [(1, "A", "r"), (2, "B", "g"), (3, "C", "g"), (4, "D", "r"), (5, "E", "g")]
for e in edges:
    graph.add_edge(ptp.Edge(e[0], e[1]))
for n in nodes:
    node = ptp.Node(name=n[0], label= n[1], fillcolor=n[2], style="filled" )
    graph.add_node(node)
graph.write_png("file.png")

【讨论】：