聚类可视化/分析的坐标图答案

【问题标题】：Coordinate Plot for Clustering Visualitzation/Analysis聚类可视化/分析的坐标图
【发布时间】：2016-06-24 05:56:18
【问题描述】：

我有一个数据集（已经缩放），总共包含 8 列：

第一列表示每个观察所属的分配集群，
和 7 个因变量（每个变量在不同的列中）。

我想通过 R 中的坐标图开发聚类可视化，就像下面的博客 (http://blog.datascienceheroes.com/short-lesson-on-cluster-analysis/) 中所示。

谁能帮我解决这个问题？

【问题讨论】：

标签： r plot graph cluster-analysis hclust

【解决方案1】：

许多选项。你可以这样做

library(GGally)
ggparcoord(aggregate(mtcars, list(as.factor(cutree(hclust(dist(mtcars)), k = 4))), mean), columns=-1, groupColumn=1)

或

library(parcoords)
parcoords(
  aggregate(mtcars, list(cutree(hclust(dist(mtcars)), k = 4)), mean),
  color = list( colorScale = htmlwidgets::JS('d3.scale.category10()'), colorBy = "Group.1")
)
parcoords(
  transform(mtcars, cluster = cutree(hclust(dist(mtcars)), k = 4)),
  color = list( colorScale = htmlwidgets::JS('d3.scale.category10()'), colorBy = "cluster")
)

【讨论】：

【解决方案2】：

你有你需要的功能的代码(plot_clus_coord)here。

【讨论】：