【发布时间】:2020-08-29 01:17:58
【问题描述】:
我正在实现一个带有 Metropolis 和 barkes alpha 的马尔可夫链 Montecarlo,用于数值积分。我创建了一个名为MCMCIntegrator() 的类。我已经为它加载了一些属性,其中之一是我们试图集成的函数(一个 lambda)的 pdf,称为 g。
import numpy as np
import scipy.stats as st
class MCMCIntegrator:
def __init__(self):
self.g = lambda x: st.gamma.pdf(x, 0, 1, scale=1 / 1.23452676)*np.abs(np.cos(1.123454156))
self.size = 10000
self.std = 0.6
self.real_int = 0.06496359
这个类还有其他方法,size是类必须生成的样本大小,std是Normal Kernel的标准差,几秒钟后你就会看到。 real_int 是我们正在积分的函数从 1 到 2 的积分值。我用 R 脚本生成了它。现在,解决问题。
def _chain(self, method=None):
"""
Markov chain heat-up with burn-in
:param method: Metrpolis or barker alpha
:return: np.array containing the sample
"""
old = 0
sample = np.zeros(int(self.size * 1.5))
i = 0
if method:
def alpha(a, b): return min(1, self.g(b) / self.g(a))
else:
def alpha(a, b): return self.g(b) / (self.g(a) + self.g(b))
while i != len(sample):
if new < 0:
new = st.norm(loc=old, scale=self.std).rvs()
alpha = alpha(old, new)
u = st.uniform.rvs()
if alpha > u:
sample[i] = new
old = new
i += 1
return np.array(sample)
当我调用_chain() 方法时,出现以下错误:
44 while i != len(sample):
45 new = st.norm(loc=old, scale=self.std).rvs()
---> 46 alpha = alpha(old, new)
47 u = st.uniform.rvs()
48
TypeError: 'numpy.float64' object is not callable
alpha 返回一个 nnumpy.float,但我不知道为什么它说它不可调用。
【问题讨论】:
-
可调用对象类似于函数或方法,可使用
foo(...)语法。你认为alpha应该是什么,你打算用这个表达什么? -
你
alpha被重新分配,调用函数的结果...... -
@juanpa.arrivillaga,我把变量名改成了
al,我也想过,但我不知道为什么没有成功
标签: numpy oop scipy scipy.stats