GBM 和 Caret 包：间隔数无效答案

【问题标题】：GBM and Caret package: invalid number of intervalsGBM 和 Caret 包：间隔数无效
【发布时间】：2015-04-22 14:36:44
【问题描述】：

虽然我定义了 target <- factor(train$target, levels = c(0, 1))，但下面给出的代码提供了这个错误：

cut.default(y, unique(quantile(y, probs = seq(0, 1, length = cut))), : 无效的间隔数另外：警告消息：1：在 train.default(x, y, weights = w, ...) 中：不能计算回归的类别概率

这是什么意思以及如何解决这个问题？

  gbmGrid <- expand.grid(n.trees = (1:30)*10, 
                         interaction.depth = c(1, 5, 9), 
                         shrinkage = 0.1)

  fitControl <- trainControl(method = "repeatedcv", 
                             number = 5, 
                             repeats = 5, 
                             verboseIter = FALSE, 
                             returnResamp = "all",
                             classProbs = TRUE)

  target <- factor(train$target, levels = c(0, 1)) 

  gbm <- caret::train(target ~ .,
                      data = train,
                      #distribution="gaussian",
                      method = "gbm",
                      trControl = fitControl,
                      tuneGrid = gbmGrid)

  prob = predict(gbm, newdata=testing, type='prob')[,2]

【问题讨论】：

train 中的target <- factor(train$target,...) 是什么？
尝试在您的trainControl 函数中添加summaryFunction = twoClassSummary ，看看它是否有效。

标签： r r-caret gbm

【解决方案1】：

首先，不要这样做：

 target <- factor(train$target, levels = c(0, 1))

你会得到一个警告：

至少有一个类级别不是有效的 R 变量名称；如果生成类概率，这可能会导致错误，因为变量名称将转换为：X0，X1

其次，您创建了一个名为 target 的对象。使用公式方法意味着train 将使用数据框train 中名为target 的列，它们是不同的数据。修改列。

【讨论】：